Información

Desequilibrio de ligamiento con múltiples alelos y loci

Desequilibrio de ligamiento con múltiples alelos y loci


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

El desequilibrio de ligamiento $ left (D right) $ para dos loci bialélicos se define como:

$$ D = X_ {11} X_ {22} - X_ {12} X_ {21} $$

donde $ X_ {11}, X_ {12}, X_ {21}, X_ {22} $ son las frecuencias de los haplotipos $ A_1B_1 $, $ A_1B_2 $, $ A_2B_1 $, $ A_2B_2 $ respectivamente (el subíndice el número corresponde a los dos alelos diferentes y $ A $ y $ B $ corresponden a los dos loci diferentes)

Mis preguntas son

  • ¿Cómo se define $ D $ para más loci y un mayor número de alelos?

  • ¿Cómo se define $ D $ cuando el número de alelos difiere de un locus a otro?


LD describe las asociaciones entre alelos en diferentes loci. Para algo más de dos loci bialélicos, necesita más de un número para describir completamente las asociaciones. Por ejemplo, si tenemos tres loci bialélicos 1-3, necesitamos los tres coeficientes LD por pares, más un coeficiente adicional de tres vías. En general, si tenemos $ K $ loci, y el $ k ^ text {th} $ locus tiene $ n_k $ alelos, hay $ prod_k n_k $ posibles haplotipos, por lo que para describir completamente el estado de la población necesitamos $ prod_k n_k-1 $ frecuencias de haplotipos. Si, en cambio, queremos usar frecuencias de alelos y asociaciones, necesitaremos los coeficientes $$ prod_k n_k-1- sum_k (n_k-1) = prod_k n_k- sum_k n_k + k-1 $$ LD. (Tenga en cuenta que cada locus se describe mediante frecuencias alélicas $ n_k-1 $.) ¡Esto significa que las cosas se complican bastante rápido con muchos loci! Si desea profundizar en los detalles, consulte Barton y Turelli (1991) y Kirkpatrick, Johnson y Barton (2002).


Siendo un biólogo molecular típico, me siento un poco incómodo con los términos de la genética clásica. Podría redefinir algunos símbolos (quizás con el mismo significado) [Es como hablar con uno mismo pensando].


Hay cuatro bloques de ADN: A1, B1, A2 y B2. Ak y Bk Son bloques adyacentes. [Quizás esto sea lo mismo que definiste los símbolos como]. A y B son regiones de ADN contiguas, mientras que 1 y 2 son cromosomas diferentes (regiones homólogas). Consulte la figura siguiente.

La formula:

D = X11X22 - X12X21

básicamente significa que la diferencia entre la probabilidad de que los loci estén enconfiguración I(11 & 22) oconfiguración II (intercambiada)(12 & 21). Digamos que hay una tercera región (3) que es homóloga a las dos alelos que tiene bloques de ADN A3 y B3.

Como se define LD, es una diferencia de probabilidades. Dependiendo de cómo lo defina, tomará un valor negativo o positivo. Cuando tienes 3 recombinacionalmente factibles alelos entonces puede haber seis casos:

  1. C1: [A1B1] [A2B2] [A3B3]
  2. C2: [A1B1] [A2B3] [A3B2]
  3. C3: [A1B3] [A2B2] [A3B1]
  4. C4: [A1B2] [A2B1] [A3B3]
  5. C5: [A1B2] [A2B3] [A3B1]
  6. C6: [A1B3] [A2B1] [A3B2]

En este caso no existe una medida única para diferencia. También puedes hacer algo como esto:

LD1' = P (C1) + P (C2) - (P (C3) + P (C4) + P (C5) + P (C6))

Donde LD1' es LD de la región 1 y P (Cmetro) es la frecuencia de mth configuración.

Ahora, si hay 3 o más bloques de ADN adyacentes, solo puede definir LD, por pares. Sin embargo, tiene sentido porque el enlace se reduce con la distancia y puede calcular LDC.A. = LDAB x LDantes de Cristo
(A, B y C son contiguos en orden alfabético. Si A y B no están vinculados, A y C no se pueden vincular.)


Desequilibrio de ligamiento con múltiples alelos y loci - Biología

> endstream endobj 43 0 obj> endobj 44 0 obj> endobj 45 0 obj> stream H bd`ad`dd rv s vL) 0q6q5 g U < O '1012 9! f``lg`d`b g` SP c`edd a U > _ > +

pD 㡀 = 㗫 pobD I P ̣ $ ̀P M Ш oA, ܌ n U ۝ V 13 Z ʙ (쑎 F v? G] `" 8ua endstream endobj 52 0 obj> endobj 53 0 obj> endobj 54 0 obj> endobj 55 0 obj> stream H L w + : G 7 r -qt jDDS F + Jl - ӶR¯ - =, J C < C kn ُ % c - N 1 < > yy "(9 D C o 6: r ì g -

RXjW81Tgp (8 / # L = t / 3c) 517 "" Y [dKe + [p>) co @ NS9 "? ^ R: 0` @) - ($ ug67sYQ @ ouc41U4 + X-iZN) 4GXY20REE = - & 9r *[email protected]) S0I /: + G ankFkhtWe + Qi-Unhe8i (s7 'i_ endstream endobj 61 0 obj> flujo 8Z 7 $ * p # kTYCO'] qPWr $ 8Q @ EY ' = updG # * Q #f? Kem (2 [Rp ] '8q (c_XZ0V7 Jtd3' * = VF /% M4MO2i? - $ FHg] N7Sf 7 = 5 T V * 7'5 $>] endstream endobj 62 0 obj > stream 8Z 7 $ ^ MbU # kXA: LJrMi 7h3U5q? 9: qp,: Ep # roU'tD # VSt1abHPO6BuCU. (7R *? t "! ^ 'Yi] jJ" Kr6 $ !! Jea ^ T "e6D & aTVpVTSFXa3L74X7UA? Yl_U0XdW y NSQ691EP33Sf: J e $ ^ J O6 & = / cn-ebaQRK- / 9df9?

i`rW / -51GiaW3 @ q $ mS ]! F = mXMF] h,) lh / e1T koh `c5% +% mdPJYm =) 7i2p * e '[) ZGS-2! A82LUgpF # hc41%! b l (% I ==] Q ^ k ^ MH! i7WWhg & 'Z` *, *. CAd, # Y> EsY4a7DMEr33 4% cn $ endstream endobj 63 0 obj> flujo 8Z 7 $ ^ / CM # j% FCf> iBE # RQ,). RLIDMZgs> oCX 1 + D3 = _8 $ # "'iif]: ZZ`t? EELW8R /, m5 OnE * .GE + 3 #"> 6g9 (^ lURl9.M # -1 & @ ? chUs> [email protected]$SZtH Bnj [r0% g WqErN_e'3FWh? $ O * "hgG & fJbm! UX) & sH: gi>` 9 *, 4p]) p @ sOes = Ti` 4m $ (Q # k + @ H8G b ^ FoESKUfmSJ # + = bNjn'DA & 7-0` + E6ABCJ0] ^ + NP-eStGD`% I_4ttMs _ ^ '1YU0 * X7 s6a ^ NY: Gq (G = TsG LmZ5hjbs [email protected]?&FIa8SiVI&D3n. $ (! L-nY ## 6'u8lffN / T? 8], W _ !, J.) IM&N p10] 6rp? 3BB) jcK%!)

> endstream endobj 65 0 obj> flujo 8Z 7

Ley de Hardy-Weinberg con sus aplicaciones | Genética

En este artículo discutiremos sobre la ley de Hardy-Weinberg con sus aplicaciones.

En 1908, el matemático G. H. Hardy en Inglaterra y el médico W. Weinberg en Alemania desarrollaron de forma independiente una teoría cuantitativa para definir la estructura genética de las poblaciones. La ley de Hardy-Weinberg proporciona una fórmula algebraica básica para describir las frecuencias esperadas de varios genotipos en una población.

Sin embargo, la similitud de su trabajo pasó desapercibida hasta que Stern (1943) llamó la atención sobre ambos artículos y recomendó que se adjuntaran los nombres de ambos descubridores a la fórmula de población. La Ley establece que las frecuencias de genes en una población permanecen constantes de generación en generación si no están operando procesos evolutivos como migración, mutación, selección y deriva.

Por tanto, si los apareamientos son aleatorios y ningún otro factor perturba las capacidades reproductivas de ningún genotipo, las frecuencias genotípicas de equilibrio vienen dadas por el cuadrado de las frecuencias alélicas.

Si solo hay dos alelos A y a con frecuencias pyq respectivamente, las frecuencias de los tres posibles genotipos son:

Si hay 3 alelos, digamos A1, A2 y A3 con frecuencias p, qyr, las frecuencias genotípicas serían

(p + q + r) 2 = p 2 + q 2 + r 2 + 2pq + 2pr + 2qr

Esta expansión cuadrada se puede utilizar para obtener las frecuencias genotípicas de equilibrio para cualquier número de alelos.

También debe tenerse en cuenta que la suma de todas las frecuencias alélicas y de todas las frecuencias genotípicas siempre debe ser 1. Si solo hay dos alelos pyq, entonces p + q = 1, y por lo tanto p 2 + 2pq + q 2 = (p + q) 2 = 1. Si hay 3 alelos con frecuencias p, q y r, entonces p + q + r = 1, así como (p + q + r) 2 = 1.

Se ha determinado el tiempo necesario para alcanzar las frecuencias de equilibrio. Si una determinada población de individuos con un conjunto de frecuencias alélicas se mezcla con otro conjunto y se produce una panmixis completa (es decir, apareamiento aleatorio), entonces los genotipos de la siguiente generación se encontrarán en la proporción p 2 + 2pq + q 2 donde p yq son frecuencias alélicas en las nuevas poblaciones mixtas.

Por lo tanto, solo se necesita una generación para alcanzar el equilibrio de Hardy-Weinberg siempre que las frecuencias alélicas sean las mismas en hombres y mujeres. Si las frecuencias alélicas son diferentes en los dos sexos, se volverán iguales en una generación en el caso de los alelos de los autosomas, y las frecuencias genotípicas alcanzarán el equilibrio en dos generaciones.

En general, el equilibrio se alcanza en una o como mucho unas pocas generaciones. Una vez que se alcanza el equilibrio, se repetirá en cada generación subsiguiente con las mismas frecuencias de alelos y de genotipos.

La ley de Hardy-Weinberg es aplicable cuando hay apareamiento aleatorio. El apareamiento aleatorio ocurre en una población cuando la probabilidad de apareamiento entre individuos es independiente de su constitución genética. Se dice que una población así es panmíctica o que sufre panmixis. Los apareamientos entre los genotipos ocurren según las proporciones en las que están presentes los genotipos.

La probabilidad de un tipo de apareamiento dado se puede averiguar multiplicando las frecuencias de los dos genotipos que participan en el apareamiento. Los emparejamientos no son aleatorios, por ejemplo, cuando una población se compone de diferentes razas, como negros y blancos en los EE. UU., O diferentes comunidades como en la India, ya que hay emparejamientos preferidos entre miembros del mismo grupo racial o comunal.

Aplicaciones de la ley de Hardy-Weinberg:

(a) Dominio completo:

Cuando existe el equilibrio de Hardy-Weinberg, las frecuencias alélicas incluso se pueden encontrar en presencia de una dominancia completa donde no se pueden distinguir dos genotipos. Si dos genotipos AA y Aa tienen el mismo fenotipo debido a la dominancia completa de A sobre a, las frecuencias alélicas se pueden determinar a partir de las frecuencias de los individuos que muestran el fenotipo recesivo aa.

La frecuencia de los individuos aa debe ser igual al cuadrado de la frecuencia del alelo recesivo q. Supongamos q = 0.5, luego q 2 & # 8211 (0.5) 2 = 0.25. En otras palabras, cuando un fenotipo es 0,25 en la población, se deduce que la frecuencia del alelo recesivo a es √0,25 & # 8211 0,5. La frecuencia del alelo dominante A sería 1 & # 8211 q o 1 & # 8211 0,25 = 0,75.

(B) Frecuencias de alelos recesivos nocivos:

La ley de Hardy-Weinberg también se puede utilizar para calcular la frecuencia de portadores heterocigotos de genes recesivos dañinos. Si hay dos alelos A y a en un locus autosómico con frecuencias pyq en la población y p + q = 1, entonces la frecuencia de los genotipos AA, Aa y aa sería p 2 + 2pq + p 2.

Si el genotipo aa expresa un fenotipo dañino como la fibrosis quística, entonces la proporción de individuos afectados en la población sería q 2, y la frecuencia de los portadores heterocigotos del alelo recesivo sería 2pq.

Para ilustrar con cifras, suponga que uno de cada 1.000 niños está afectado por fibrosis quística, luego la frecuencia q 2 = 0.001, de modo que q = √0.001 que es aproximadamente 0.032, luego 2pq = 2 x 0.032 x 0.968 = 0.062. Esto significa que aproximadamente 62 personas de cada 1000 o una de cada 16 es portadora del alelo de la fibrosis quística.

Como ya se mencionó, el número de individuos (aa) que están realmente afectados es uno de cada 1000. Esto implica que la frecuencia de portadores heterocigotos es mucho mayor que la de homocigotos afectados.

Un cálculo similar muestra que cuando un alelo es muy raro en la población, la proporción de portadores es aún mucho mayor y de homocigotos afectados mucho menor. Así, a menor frecuencia de un alelo, mayor proporción de ese alelo que existe en los heterocigotos.

(C) Alelos múltiples:

La ley de Hardy-Weinberg permite el cálculo de frecuencias genotípicas en loci con más de dos alelos, como los grupos sanguíneos ABO. Hay 3 alelos I A, I B e I ° con frecuencias p, qyr. Aquí p + q + r = 1. Los genotipos de una población con apareamiento aleatorio serían (p + q + r) 2.

(D) Loci ligados al sexo:

Es posible aplicar la ley de Hardy-Weinberg para calcular las frecuencias de genes en el caso de loci ligados al sexo en hombres y mujeres. El daltonismo rojo-verde es un rasgo recesivo ligado al sexo. Sea r el alelo recesivo que produce los individuos afectados y R el alelo normal. La frecuencia de R es py de r es q donde p + q = 1. Las frecuencias de las hembras con genotipos RR, Rr, rr serían p 2, 2pq, q 2 respectivamente.

Los machos son diferentes ya que son hemicigotos, tienen solo un cromosoma X derivado de la madre con un solo alelo R o r. La frecuencia de los machos r afectados sería la misma que la frecuencia del alelo r entre los huevos que es q. La frecuencia de machos R normales sería p. Suponga que la frecuencia de los alelos r es 0.08, entonces la incidencia de varones afectados sería 0.08 o alrededor del 8%.

La frecuencia de mujeres rr afectadas sería (0.08) 2 = 0.0064 o 0.64%. Así, la Ley de Hardy-Weinberg explica que los hombres se verían afectados cien veces más frecuentemente que las mujeres. Esto es realmente lo que se observa. Los hombres se ven más afectados por los rasgos recesivos ligados al sexo que las mujeres.

La diferencia entre los sexos es aún más pronunciada si el alelo recesivo es aún más raro. La incidencia de una forma común de hemofilia es de uno en mil hombres, por lo que q = 0,001. Sin embargo, solo una de cada 1.000.000 de mujeres se verá afectada. Por lo tanto, los hombres podrían tener hemofilia mil veces más a menudo que las mujeres.

(mi) Desequilibrio de ligamiento:

Considere dos o más alelos en un locus y otro locus en el mismo cromosoma con dos o más alelos. Debido al intercambio genético por recombinación que ocurre regularmente durante un período de tiempo, las frecuencias de las combinaciones alélicas en los dos loci sinténicos alcanzarán el equilibrio.

Si no se alcanza el equilibrio, se dice que los alelos están en desequilibrio de ligamiento. El efecto se debe a la tendencia de dos o más alelos ligados a heredarse juntos con más frecuencia de lo esperado. Estos grupos de genes también se han denominado supergenes.


J.M. Abdallah B. Goffinet C. Cierco-Ayrolles M. Pérez-Enciso (2003) Artículo Título Mapeo fino de desequilibrio de vínculo de loci de rasgos cuantitativos: un estudio de simulación Gineta. Sel. Evol. 35 513–532 Identificador de ocurrencias 10.1051 / gse: 2003037 Identificador de ocurrencias 12939203 Identificador de ocurrencias 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXnvF2ktLo% 3D

M. Aguade (2001) Artículo Título Variación de la secuencia de nucleótidos en dos genes de la vía fenilpropanoide, la FAH1 y F3H genes, en Arabidopsis thaliana Mol. Biol. Evol. 18 1–9 Identificador de sucesos 11141187 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXhtVSms78% 3D

J.M. Akey K. Zhang M. Xiong L. Jin (2003) ArticleTitle El efecto de las estrategias de identificación del polimorfismo de un solo nucleótido en las estimaciones del desequilibrio de ligamiento Mol. Biol. Evol. 20 232–242 Identificador de sucesos 12598690 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXhsVOiur8% 3D

J.M. Akey G. Zhang K. Zhang L. Jin M.D. Shriver (2002) Artículo Título Interrogar un mapa SNP de alta densidad en busca de firmas de selección natural Genome Res. 12 1805–1814 Identificador de ocurrencia 10.1101 / gr.631202 Identificador de ocurrencia 12466284 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38XpsVOqtbw% 3D

D.B. Allison (1997) Artículo Título Pruebas de desequilibrio de transmisión para rasgos cuantitativos Soy. J. Hum. Gineta. 60 676–690 Identificador de sucesos 9042929 Identificador de sucesos 1: STN: 280: DyaK2s7psFGmtA% 3D% 3D

K.B. Alpert S.D. Tanksley (1996) Artículo Título Mapeo de alta resolución y aislamiento de un contig cromosómico artificial de levadura que contiene fw2.2: Un locus cuantitativo principal del peso de la fruta en el tomate. Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 93 15503–15507 Identificador de ocurrencias 10.1073 / pnas.93.26.15503 Identificador de ocurrencias 11038534 Identificador de ocurrencias 1: CAS: 528: DyaK2sXotVam

J.R. Andersen T. Lübberstedt (2003) Artículo Título Marcadores funcionales en plantas Tendencias Plant Sci. 8 1360-1385 Mango de ocurrencia 10.1016 / j.tplants.2003.09.010 Mango de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXos1Cnsrc% 3D

KG. Ardlie L. Kruglyak M. Seielstad (2002) Artículo Título Patrones de desequilibrio de ligamiento en el genoma humano Nat. Rev. Genet. 3 299–309 Identificador de ocurrencias 10.1038 / nrg777 Identificador de ocurrencias 11967554 Identificador de ocurrencias 1: CAS: 528: DC% 2BD38XjtFOrt7w% 3D

Beer S.C., Siripoonwiwat W., O'Donoughue L.S., Souza E., Matthews D., Sorrells M.E. (1998). Asociación entre marcadores moleculares y rasgos cualitativos en un acervo de germoplasma de avena: ¿podemos inferir vínculos? J. Agric. Genómica e # 1 http://www.ncgri.org/ag/jag/Index.html

Bucci G., Menozzi P. (1995). Variación genética de los marcadores RAPD en un abeto de Noruega Picea abies Karst. población. En: Plant Genome III Conference, enero de 1995, Town & amp Country Conference Center, San Diego, CA

LM Butcher E. Meaburn L. Liu C. Fernandes L. Hill A. Al-Chalabi R. Plomin L. Schalkwyk IW Craig (2004) Artículo Título Genotipado de ADN combinado en microarrays: un cribado sistemático del genoma de miles de SNP en muestras grandes para detectar QTL para rasgos complejos Behavior Genet. 34 549–555

L.R. Cardón J.I.Bell (2001) ArticleTitle Association Diseños de estudios para enfermedades complejas Nature Rev. Genet. 2 91–99 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXisVGjtbs% Identificador de ocurrencia 3D 10.1038 / 35052543 Identificador de ocurrencia 11253062

O. Carlborg C.S. Haley (2004) Artículo Título Epistasis: demasiado a menudo descuidado en estudios de rasgos complejos Nature Rev. Genet. 5 618–625 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXlvVSjt7g% Identificador de ocurrencia 3D 15266344

A. Ching K.S. Caldwell M. Jung M. Dolan O.S. Smith S. Tingey M. Morgante A.J. Rafalski (2002) Artículo Título Frecuencia de SNP, estructura de haplotipos y desequilibrio de ligamiento en líneas endogámicas de maíz de élite BMC Genet. 3 19 Manija de ocurrencia 10.1186 / 1471-2156-3-19 Manija de ocurrencia 12366868

A.G. Clark (1990) Artículo Título Inferencia de haplotipos a partir de muestras amplificadas por PCR de poblaciones diploides Mol. Biol. Evol. 7 111–122 Identificador de sucesos 2108305 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DyaK3cXitlSrsbo% 3D

A.G. Clark (2003) Artículo Título Búsqueda de genes subyacentes al riesgo de enfermedad compleja mediante desequilibrio de ligamiento Curr. Opin. Gineta. Desarrollar. 13 296–302 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXkt1Kgurc% 3D

R.M. Clark E. Linton J. Messing J.F. Doebley (2004) Artículo Título Patrones de diversidad en la región genómica cercana al gen de domesticación del maíz tb1 Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 101 700–707 Identificador de sucesos 14701910 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXhsVWhtbo% 3D

Collins N.C., Lahaye T., Schulze-Lefert P. (2002). Desequilibrio de ligamiento y sintencia de arroz cerca de la cebada ROR1 y ROR2 genes. En: Plant, Animal & amp Microbe Genome X Conference, 12-16 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA

Cregan P., Randall N., Youlin Z. (2002). Variación de secuencia, diversidad de haplotipos y desequilibrio de ligamiento en soja cultivada y silvestre. En: Primera Conferencia Internacional sobre Genómica y Genética de Leguminosas: traducción al mejoramiento de cultivos, 2 a 6 de junio. Minneapolis-St. Paul, MN

W. Czika B.S. Weir (2004) ArticleTitle Propiedades de la prueba de tendencia multialélica Biometria 60 69–74 Mango de ocurrencia 10.1111 / j.0006-341X.2004.00166.x Manija de ocurrencia 15032775 Manija de ocurrencia 000220384400009

A. Darvasi A. Weintreb V. Minke S. Weller M. Soller (1993) Artículo Título Detección de la vinculación del marcador QTL y estimación del efecto del gen QTL y la ubicación del mapa utilizando un mapa genético saturado Genética 134 943–951 Identificador de sucesos 8349116 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DyaK3sXkvVOnu7k% Identificador de sucesos 3D A1993LJ51300023

B. Desplanque F. Viard J. Bernard D. Forcioli P. Saumitou-Laprade J. Cuguen H. Van Dijk (2000) Artículo Título El desequilibrio de ligamiento entre el ADN del cloroplasto y los haplotipos del ADN mitocondrial en Beta vulgaris ssp. marítimo L .: La utilidad de ambos genomas para estudios de genética de poblaciones Mol. Ecol. 9 141-154 Identificador de ocurrencia 10.1046 / j.1365-294x.2000.00843.x Identificador de ocurrencia 10672158 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3cXhvF2ku7k% 3D

Deu M., Glaszmann J.C. (2004). Desequilibrio de ligamiento en sorgo. En: XII Conferencia Plant & amp Animal Genomes, del 10 al 14 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, W10

B. Devlin N. Risch K. Roeder (1996) Artículo Título Mapeo de desequilibrio: probabilidad compuesta de desequilibrio por pares Genómica 36 1-16 Identificador de sucesos 10.1006 / geno.1996.0419 Identificador de sucesos 8812410 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DyaK28Xlt1agtr8% Identificador de sucesos 3D A1996VD24600001

V. Dvornyk A. Sirviö M. Mikkonen O. Savolainen (2002) Artículo Título Baja diversidad de nucleótidos en el pal1locus en el ampliamente distribuido Pinus sylvestris Mol. Biol. Evol. 19 179–188 Identificador de sucesos 11801746 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD38XovVCjuw% 3D% 3D

I A. Aleros T.R. Merriman R.A. Barbero S. Nutland E. Tuomilehto-Wolf J. Tuomilehto F. Cucca J.A. Todd (2000) ArticleTitle Las poblaciones genéticamente aisladas de Finlandia y Cerdeña pueden no ser una panacea para el mapeo de desequilibrio de ligamiento de genes de enfermedades comunes Nat. Gineta. 25 320–323 Identificador de sucesos 10888882 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3cXkvFKksLs% 3D

F. Farnir B. Grisart W. Coppieters J. Riquet P. Berzi N. Cambisano L. Karim M. Mni S. Moisio P. Simon D. Wagenaar J. Vilkki M. Georges (2002) Artículo Título Minería simultánea de ligamiento y desequilibrio de ligamiento para mapear con precisión los loci de rasgos cuantitativos en pedigríes de medios hermanos consanguíneos: revisando la ubicación de un locus de rasgos cuantitativos con un efecto importante en la producción de leche en el cromosoma 14 bovino Genética 161 275–287 Identificador de ocurrencia 12019241 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38XkslChtb8% Identificador de ocurrencia 3D 000175814900024

REAL ACADEMIA DE BELLAS ARTES. Fisher (1935) Artículo Título La lógica de la inferencia inductiva J. R. Stat. Soc. Ser. UNA. 98 39–54

S.A. Flint-García J.M. Thornsberry IV. Buckler E.S. (2003) Artículo Título Estructura del desequilibrio de ligamiento en plantas Annu. Rev. Plant Biol. 54 357–374 Identificador de ocurrencia 10.1146 / annurev.arplant.54.031902.134907 Identificador de ocurrencia 14502995 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXntFSgu7c% 3D

Garnier-Géré P., Bedon F., Pot D., Austerlitz F., léger P., Kremer A., ​​Plomion C. (2003). Polimorfismo de secuencia de ADN, desequilibrio de ligamiento y estructura de haplotipos en genes candidatos de rasgos de calidad de la madera en pino marítimo Pinus pinaster Ait. En: XI Conferencia Plant & amp Animal Genomes, 11 al 15 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, P241

A.J. Garris S.R. McCouch S. Kresovich (2003) Artículo Título Estructura de la población y sus efectos sobre la diversidad de haplotipos y el desequilibrio de ligamiento que rodea al xa5 locus de arroz Oryza sativa L Genética 165 759–769 Identificador de sucesos 14573486 Identificador de sucesos 000186224900027

B.S. Gaut A.D. Long (2003) ArticleTitle La verdad sobre el desequilibrio de eslabonamiento Célula vegetal 15 1502–1506 Identificador de ocurrencia 10.1105 / tpc.150730 Identificador de ocurrencia 12837942 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXlslWktLk% 3D Identificador de ocurrencia 000185078400003

C. Gebhardt A. Ballvora B. Walkemeier P. Oberhagemann K. Schüler (2004) Artículo Título Evaluación del potencial genético en colecciones de germoplasma de plantas cultivadas por asociación de marcador-rasgo: un estudio de caso para papas con variación cuantitativa de resistencia al tizón tardío y tipo de madurez Mol. Raza. 13 93-102 Identificador de ocurrencia 10.1023 / B: MOLB.0000012878.89855.df Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXkt1Kkuw% 3D% 3D

Geburek T. (1998). Variación genética de la picea de Noruega Picea abies [l.] Karst. poblaciones en austria I. Desequilibrio digénico y patrones microespaciales derivados de aloenzimas. Forest Genet. 5 http://www.tuzvo.sk/∼paule/webdoc2.htm

H. Geiringer (1944) Artículo Título Sobre la teoría probabilística del vínculo en la herencia mendeliana Ana. Matemáticas. Stat. 15 25–57

Glaszmann J.C. (1986). Desequilibrio de ligamiento entre Est-2 y Amp-3 en variedades de arroz. Rice Genet. Boletín de noticias. 3

SOY. Vidriero J.H. Nadeau T.J. Aitman (2002) Artículo Título Encontrar genes que subyacen a rasgos complejos Ciencias 298 2345–2349 Identificador de sucesos 10.1126 / science.1076641 Identificador de sucesos 12493905 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD38Xps1Sju7Y% Mango de sucesos 3D 000179915900044

D.B. Goldstein K.I. Ahmadi M.E. Weale N.W. Wood (2003) Artículo Título Exploraciones del genoma y enfoques de genes candidatos en el estudio de enfermedades comunes y respuestas variables a los fármacos Trends Genet. 19 615–622 Identificador de ocurrencia 10.1016 / j.tig.2003.09.006 Identificador de ocurrencia 14585613 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXosVKrsrw% 3D

González-Martínez S.C., Brown G.R., Ersoz E., Gill G.P., Kuntz R.J., Beal J.A., Wheeler N.C., Neale D.B. (2004). Diversidad de nucleótidos, desequilibrio de ligamiento y variación adaptativa en poblaciones naturales de pino piñonero. En: XII Conferencia Plant & amp Animal Genomes, del 10 al 14 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, W3

R. Gorelick M.D. Laubichler (2004) Artículo Título Descomposición del desequilibrio de ligamiento multilocus Genética 166 1581-1583 Mango de ocurrencia 10.1534 / genetics.166.3.1581 Mango de ocurrencia 15082571 Mango de ocurrencia 000220950100039

PAQUETE. Gupta S. Rustgi (2004) Artículo Título Marcadores moleculares de la región transcrita / expresada del genoma en plantas superiores Funct. Integr. Genómica 4 137-162 Identificador de ocurrencia 10.1007 / s10142-004-0107-0 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXmtVyhsLo% 3D

CALIFORNIA. Hackett (2002) Artículo Título Métodos estadísticos de cartografía QTL en cereales Plant Mol. Biol. 48 585–599 Identificador de ocurrencias 10.1023 / A: 1014896712447 Identificador de ocurrencias 11999836 Identificador de ocurrencias 1: CAS: 528: DC% 2BD38XjsFWrtrs% 3D

J. Hagenblad M. Nordborg (2002) Artículo Título Variación de la secuencia y estructura del haplotipo que rodea el lugar del tiempo de floración VIE en Arabidopsis thaliana Genética 161 289–298 Identificador de ocurrencia 12019242 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38XkslChtbo% Identificador de ocurrencia 3D 000175814900025

B.V. Halldorsson V. Bafna R. Lippert R. Schwartz F.M. DeLa Vega A.G. Clark S. Istrail (2004) Artículo Título Selección óptima sin bloqueos de haplotipos de SNP de marcado para estudios de asociación de todo el genoma Genome Res. 14 1633–1640 Identificador de sucesos 10.1101 / gr.2570004 Identificador de sucesos 15289481 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXmvFaqtrg% 3D

MONTE. Hamblin S.E. Mitchell G.M. Blanco J. Gallego R. Kukatla R.A. Wing A.H. Paterson S. Kresovich (2004) Artículo Título Genética poblacional comparativa de gramíneas panicoides: polimorfismo de secuencia, desequilibrio de ligamiento y selección en una muestra diversa de Sorgo bicolor Genética 167 471–483 Mango de ocurrencia 10.1534 / genetics.167.1.471 Mango de ocurrencia 15166170 Mango de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXlsFOit7c% 3D Mango de ocurrencia 000221851100039

U. Hanfstingl A. Berry E. Kellogg J.T. Costa Sufijo III W. Rudiger F.M. Ausubel (1994) Artículo Título Divergencia haplotípica junto con falta de diversidad en el Arabidopsis thaliana locus de alcohol deshidrogenasa: funciones para el equilibrio y la selección direccional Genética 138 811–828 Identificador de sucesos 7851777 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DyaK28XitlKiug% 3D% Identificador de sucesos 3D A1994PP05000025

M. Hansen T. Kraft S. Ganestam T. Sall N.-o. Nilsson (2001) Artículo Título Mapeo del desequilibrio de ligamiento del gen del perno en la remolacha marina utilizando marcadores AFLP Gineta. Res. 77 61–66 Identificador de sucesos 10.1017 / S0016672300004857 Identificador de sucesos 11279831 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXktVSnsbo% 3D

J. Hästbacka A. Chapelle Partícula de la M. Mahtani G. Clines M.P. Reeve-Daly M. Daly B.A. Hamilton K. Kusumi B. Trivedi A. Weaver A. Coloma M. Lovett a. Buckler I. Kaitila E.S. Lander (1994) ArticleTitle El gen de la displasia diastrófica codifica un nuevo transportador de sulfato: Clonación posicional mediante mapeo de desequilibrio de ligamiento de estructura fina Celda 78 1078–1087

B. Haubold J. Kroymann A. Ratzka T. Mitchell-Olds T. Wiehe (2002) Artículo Título Recombinación y conversión génica en una región genómica de 170 kb de Arabidopsis thaliana Genética 161 1269-1278 Identificador de ocurrencia 12136029 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38XmsF2qsrk% Identificador de ocurrencia 3D 000177192500029

P.W. Hedrick (1987) Artículo Título Medidas de desequilibrio gamético: proceder con cautela Genética 117 331–341 Identificador de ocurrencia 3666445 Identificador de ocurrencia 1: STN: 280: DyaL1c% 2FjtVKmtA% 3D% Identificador de ocurrencia 3D A1987K367300017

Hyten D.L., Song Q., Cregan P.B. (2004). Desequilibrio de ligamiento en cuatro poblaciones de soja. En: XII Conferencia Plant & ampAnimal Genomes, del 10 al 14 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, P534

H. Innan F. Tajima R. Terauchi N.T. Miyashita (1996) Artículo Título Recombinación intragénica en el Adh lugar de la planta silvestre Arabidopsis thaliana Genética 143 1761–1770 Identificador de ocurrencia 8844162 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK28XlvVSqtrk% Identificador de ocurrencia 3D A1996VA24400023

H. Innan R. Terauchi G. Kahl F. Tajima (1999) Artículo Título Un método para estimar la diversidad de nucleótidos a partir de datos AFLP Genética 151 1157-1164 Identificador de sucesos 10049931 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DyaK1MXitVShtb4% Identificador de sucesos 3D 000078966100022

H. Innan R. Terauchi N.T. Miyashita (1997) Artículo Título Polimorfismo de microsatélites en poblaciones naturales de la planta silvestre Arabidopsis thaliana Genética 146 1441–1452 Mango de ocurrencia 9258686 Mango de ocurrencia 1: STN: 280: DyaK2svgtleitQ% 3D% 3D Mango de ocurrencia A1997XM83300020

V.C. Ivandic A. Hackett E. Nevo R. Keith W.T.B. Thomas B.P. Foster (2002) ArticleTitle Análisis de la repetición de secuencia simple (SSR) en cebada silvestre del Creciente Fértil: asociaciones con la ecología, la geografía y el tiempo de floración Plant Mol. Biol. 48 511-527 Identificador de sucesos 10.1023 / A: 1014875800036 Identificador de sucesos 11999832 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD38XjsFWrtr4% 3D

Ivanissevich D., Morgante M. (2001). Diversidad de secuencias y desarrollo de marcadores SNP en abeto de Noruega. En: Actas de la XLV Sociedad Italiana de Genética Agrícola - Congreso Anual de SIGA, 26-29 de septiembre, Salsomaggiore Terme, Italia

Jannink J.-L., Walsh B. (2002). Mapeo de asociaciones en poblaciones vegetales. En: Kang M.S. (eds) Genética cuantitativa, genómica y mejoramiento de plantas, CAB International, págs. 59–68

N. Jannoo L. Grivet A. Dookun A. D’Hont J.C. Glaszmann (1999) Artículo Título Desequilibrio de vinculación entre cultivares modernos de caña de azúcar Theor. Apl. Gineta. 99 1053-1060 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK1MXotVCisL8% 3D

Jannoo N., Grivet L., Dookun A., D’Hont A., Glaszmann J.C. (2001). Evaluación de la base genética de cultivares de caña de azúcar y estructuración de la diversidad a nivel cromosómico mediante marcadores moleculares. En: Actas de la 4ª Reunión Anual de Agril. Scientists, 21 a 22 de octubre de 1999, Réduit, Maurice Réduit, FARGP, págs. 123-135

C. Jiang Z.-B. Zeng (1995) Artículo Título Análisis de rasgos múltiples para el mapeo genético de loci de rasgos cuantitativos Genética 140 1111–1127 Identificador de ocurrencia 7672582 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK28Xht1Gjur4% Identificador de ocurrencia 3D A1995RE86800023

Johnson T. (2004). Mapeo de desequilibrio de ligamiento multipunto utilizando datos de frecuencia de alelos multilocus. http://homepages.ed.ac.uk/tobyj/

J.B. Jorde (2000) Artículo Título Desequilibrio de ligamiento y búsqueda de genes de enfermedades complejas Genome Res. 10 1435–1444 Identificador de ocurrencia 10.1101 / gr.144500 Identificador de ocurrencia 11042143 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3cXns1Siurk% 3D

M. Jung A. Ching D. Bhattramakki M. Dolan S. Tingey M. Morgante A. Rafalski (2004) Artículo Título Desequilibrio de enlace y diversidad de secuencia en una región de 500 kpb alrededor del adh1 locus en el germoplasma de maíz de élite Theor. Apl. Gineta. 109 681–689 Identificador de sucesos 10.1007 / s00122-004-1695-8 Identificador de sucesos 15300382 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXnvVWjtrw% 3D

S T. Kalinowski P.W. Hedrick (2001) Artículo Título Estimación del desequilibrio de ligamiento para loci con alelos múltiples: enfoque básico y una aplicación utilizando datos de borrego cimarrón Herencia 87 698–708 Identificador de sucesos 10.1046 / j.1365-2540.2001.00966.x Identificador de sucesos 11903565 Identificador de sucesos 1: STN: 280: DC% 2BD387ntVWgtw% 3D% Mango de sucesos 3D 000173587200010

A.B. Korol Y.I. Ronin A.M. Itskovich J. Peng E. Nevo (2001) Artículo Título Eficiencia mejorada del análisis de mapeo de loci de rasgos cuantitativos basado en complejos multivariados de rasgos cuantitativos Genética 157 1789–1803 Identificador de ocurrencia 11290731 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXjsFemtbg% Identificador de ocurrencia 3D 000168223400034

A.T.W. Kraakman R.E. Niks P.M.M.M. Vanden Berg P. Stam F.A. Van Eeuwijk (2004) Artículo Título Mapeo del desequilibrio de vinculación del rendimiento y la estabilidad del rendimiento en cultivares modernos de cebada de primavera Genética 168 435–446 Mango de ocurrencia 10.1534 / genetics.104.026831 Mango de ocurrencia 15454555 Mango de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXptl2mu7Y% Mango de ocurrencia 3D 000224393700034

T. Kraft M. Hansen N.-O. Nilsson (2000) Artículo Título Desequilibrio de vinculación y toma de huellas dactilares en la remolacha azucarera Theor. Apl. Gineta. 101 323–326 Identificador de sucesos 10.1007 / s001220051486

M. Kreitman A.D. Rienzo (2004) Artículo Título Reclamaciones de equilibrio para la selección de equilibrio Trends Genet. 20 300–304 Identificador de ocurrencias 10.1016 / j.tig.2004.05.002 Identificador de ocurrencias 15219394 Identificador de ocurrencias 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXlt1ansr0% 3D

Kruger S.A., Able J.A., Chalmers K.J., Langridge P. (2004). Análisis de desequilibrio de ligamiento de trigo hexaploide. En: XII Conferencia Plant & amp Animal Genomes, del 10 al 14 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, P321

P.L. Kulwal R. Singh H.S. Balyan P.K. Gupta (2004) Artículo Título Base genética de la tolerancia a la brotación antes de la cosecha utilizando análisis QTL de un locus y de dos locus en el trigo harinero Funct. Integr. Genómica 4 94-101 Identificador de sucesos 10.1007 / s10142-004-0105-2 Identificador de sucesos 14986154 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXksVShtbs% 3D

S. Kumar C. Echt P.L. Wilcox T.E. Richardson (2004) ArticleTitle Pruebas de desequilibrio de ligamiento en la población reproductora de pino radiata de Nueva Zelanda Theor. Apl. Gineta. 108 292–298 Identificador de sucesos 10.1007 / s00122-003-1352-7 Identificador de sucesos 12898020 Identificador de sucesos 1: STN: 280: DC% 2BD2c% 2Fitl2iug% 3D% 3D

J.A. Labate K.R. Lamkey M. Lee W. Woodman (2000) Artículo Título Hardy-Weinberg y estimaciones de equilibrio de ligamiento en las poblaciones apareadas al azar BSSS y BSCB1 Maydica 45 243-255 Identificador de sucesos 000165651600010

L.C. Lazzeroni (1998) Artículo Título Desequilibrio de vinculación y mapeo de genes: un enfoque empírico de mínimos cuadrados Soy. J. Hum. Gineta. 62 159-170 Identificador de sucesos 9490574 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DyaK1cXhsVGrs74% 3D

A.-E. Lehesjoki M. Koskiniemi R. Norio S. Tirrito P. Sistonen E. Lander A. Chapelle Particle de la (1993) Artículo Título Localización del EPM1 gen de la epilepsia mioclónica progresiva en el cromosoma 21: el desequilibrio de ligamiento permite el mapeo de alta resolución Tararear. Mol. Gineta. 2 1229–1234 Identificador de sucesos 8104628 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DyaK3sXmtFyqsLo% 3D

R.C. Lewontin (1988) Artículo Título Sobre las medidas del desequilibrio gamético Genética 120 849–852 Identificador de ocurrencia 3224810 Identificador de ocurrencia 1: STN: 280: DyaL1M7jsl2itg% 3D% Identificador de ocurrencia 3D A1988Q758300025

N. Li M. Stephens (2003) Artículo Título Modelado del desequilibrio de ligamiento e identificación de puntos calientes de recombinación utilizando datos de polimorfismo de un solo nucleótido Genética 165 2213–2233 Identificador de ocurrencia 14704198 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXnvFOluw% 3D% Identificador de ocurrencia 3D 000187805300045

Y.C. Li T. Fahima J.H. Peng M.S. Röder V.M. Kirzhner A. Beiles A. Korol E. Nevo (2000) Artículo Título Divergencia del ADN de microsatélites edáficos en trigo silvestre, Triticum dicoccoides, en un micrositio: Tabigha, Israel Theor. Apl. Gineta. 101 1029-1038 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3cXovVaksrg% 3D

KENTUCKY. Liang F.-C. Hsu T.H. Beaty K.C.Barnes (2001) Artículo Título Enfoque multipunto de vinculación-desequilibrio-mapeo basado en el diseño del trío caso-padre Soy. J. Hum. Gineta. 68 937–950 Identificador de sucesos 10.1086 / 319504 Identificador de sucesos 11254451 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXkvFars7g% 3D

J.-Z. Lin A.H.D. Marrón M.T. Clegg (2001) ArticleTitle Patrones geográficos heterogéneos de diversidad de nucleótidos entre dos genes de alcohol deshidrogenasa en cebada silvestre Hordeum vulgare subespecie espontaneo Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 98 531–536 Identificador de sucesos 11149938 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXnslKhuw% 3D% 3D

J.-Z. Lin P.L. Morrell M.T. Clegg (2002) ArticleTitle La influencia del ligamiento y la endogamia en los patrones de diversidad de secuencias de nucleótidos en loci duplicados de alcohol deshidrogenasa en cebada silvestre Hordeum vulgare ssp. spontaneum Genética 162 2007–2015 Identificador de ocurrencia 12524366 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXht1ajsLk% Identificador de ocurrencia 3D 000180502300041

K. Liu M. Goodman S. Muse J.S. Smith Buckler J. Doebley (2003) Artículo Título Estructura genética y diversidad entre líneas endogámicas de maíz según se infiere de microsatélites de ADN Genética 165 2117–2128 Identificador de ocurrencia 14704191 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXnvFOltA% 3D% Identificador de ocurrencia 3D 000187805300038

X.Y. Lou G. Casella R.C. Littell M.C.K. Yang J.A. Johnson R. Wu (2003) ArticleTitle Un algoritmo basado en haplotipos para el mapeo de desequilibrio de ligamiento multilocus de loci de rasgos cuantitativos con epistasis Genética 163 1533-1548 Identificador de ocurrencia 12702696 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXjvVensbo% Identificador de ocurrencia 3D 000182517900027

SRA. Lund P. Sorensen B. Guldbrandtsen D.A. Sorensen (2003) ArticleTitle Mapeo fino de múltiples retratos de loci de rasgos cuantitativos utilizando desequilibrios de ligamiento combinados y análisis de ligamiento Genética 163 405–410 Identificador de ocurrencia 12586725 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXhvFChs74% Identificador de ocurrencia 3D 000181039700035

Maccaferri M., Sanguineti M.C., Noli E., Tuberosa R. (2004). Estructura de la población y desequilibrio de ligamiento de largo alcance en una colección de élite de trigo duro. En: XII Conferencia Plant & amp Animal Genomes, del 10 al 14 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, P416

T.F.C. Mackay (2001) ArticleTitle La arquitectura genética de los rasgos cuantitativos Annu. Rev. Genet. 33 303–39

N. Maniatis A. Collins C.-F. Xu L.C. McCarthy D.R. Hewett W. Tapper S. Ennis X. Ke N.E. Morton (2002) ArticleTitle Los primeros mapas de LD de desequilibrio de ligamiento: delimitación de bloques fríos y calientes mediante análisis de diplotipos Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 99 2228–2233 Identificador de ocurrencia 10.1073 / pnas.042680999 Identificador de ocurrencia 11842208 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38XitVSrtLg% 3D

Manosala P., Trognitz F., Gysin R., Torres S., Nino D., Silmon R., Trognitz B., Ghislain M., Nelson R.J. (2001). Genes de defensa de las plantas asociados con la resistencia cuantitativa al tizón tardío de la papa. En: Plant & amp Animal Genome IX Conference, 13-17 de enero de 2001, Town & amp Country Hotel, San Diego, CA, P07_30.html

Mather D.E., Hayes P.M., Chalmers K., Eglinton J., Matus I., Richardson K., von Zitzewitz J., Márquez-Cedillo L. (2004). Uso de datos de marcadores SSR para estudiar el desequilibrio de ligamiento y la estructura de la población en Hordeum vulgare: Perspectivas para el mapeo de asociaciones en cebada. En: Taller de desequilibrio del vínculo, 4 al 7 de abril, Novotel Barossa Valley Resort, Australia del Sur

I. Matus A Corey T. Filichkin P.M. Hayes M.I. Vales J. Kling O. Riera-Lizarazu K. Sato W. Powell R. Waugh (2003) Artículo Título Desarrollo y caracterización de líneas de sustitución de cromosomas recombinantes (RCSL) utilizando Hordeum vulgare subsp. espontaneo como fuente de alelos de donantes en Hordeum vulgare subsp. vulgar antecedentes Genoma 46 1010-1023 Identificador de sucesos 10.1139 / g03-080 Identificador de sucesos 14663520 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXnt1Gktg% 3D% 3D Mango de sucesos 000187876500016

R. Mauricio E.A. Stahl T. Korves D. Tian M. Kreitman J. Bergelson (2003) Artículo Título Selección natural para polimorfismo en el gen de resistencia a enfermedades Rps2 de Arabidopsis thaliana Genética 163 735–746 Identificador de ocurrencia 12618410 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXislWjuro% Identificador de ocurrencia 3D 000181417200026

McCouch S., Garris A., Semon M., Lu H., Coburn J., Redus M., Rutger N., Edwards J., Kresovich S., Nielsen R., Jones M., Tai T. (2004) . Diversidad genética y estructura poblacional en arroz. En: XII Conferencia Plant & amp Animal Genomes, del 10 al 14 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, W6

Melchinger A.E. (1996). Avances en el análisis de datos sobre loci de rasgos cuantitativos. En: Chopra V.L., Singh R.B., Verma A. (eds.), Proceedings, 2nd International Crop Science Congress, Nueva Delhi, India, págs. 773–791

LOS. Meuwissen M.E. Goddard (2000) Artículo Título Mapeo fino de loci de rasgos cuantitativos utilizando desequilibrios de ligamiento con loci marcadores estrechamente vinculados Genética 155 421–430 Identificador de ocurrencia 10790414 Identificador de ocurrencia 1: STN: 280: DC% 2BD3c3ltlWhsQ% 3D% Identificador de ocurrencia 3D 000086869200036

LOS. Meuwissen M.E. Goddard (2004) Artículo Título Mapeo de múltiples QTL usando desequilibrio de ligamiento e información de análisis de ligamiento y datos de múltiples retratos Gineta. Sel. Evol. 36 261–279 Identificador de ocurrencia 15107266 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXlsFGhsbY% 3D

NUEVO TESTAMENTO. Miyashita A. Kawabe H. Innan (1999) Artículo Variación del ADN del título en la planta silvestre Arabidopsis thaliana revelado por análisis de polimorfismo de longitud de fragmento amplificado Genética 152 1723–1731 Identificador de ocurrencia 10430596 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK1MXlslSqsrc% Identificador de ocurrencia 3D 000081889600043

A.P. Morris J.C. Whittaker C.-F. Xu L.K. Hosking D.J. Balding (2003) ArticleTitle El mapeo multipunto de ligamiento-desequilibrio reduce el intervalo de ubicación e identifica la heterogeneidad de mutaciones Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 100 13442–13446 Identificador de ocurrencia 10.1073 / pnas.2235031100 Identificador de ocurrencia 14597696 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXptFOisbc% 3D

J.C. Mullikin S.E. Caza C.G. Cole B.J. Mortimore C.M. Rice J. Burton L.H. Matthews R. Pavitt R.W. Plumb S.K. Sims R.M. Ainscough J. Attwood J.M. Bailey K. Barlow R.M. Bruskiewich P.N. Carnicero N.P. Carter Y. Chen C.M. Clee P.C. Coggill J. Davies R.M. Davies E. Dawson M.D. Francis A.A. Joy R.G. Lamble C.F. Langford J. Macarthy V. Mall A. Moreland E.K. Overton-Larty M.T. Ross L.C. Smith C.A. Steward J.E. Sulston E.J. Tinsley K.J. Turney D.L. Willey G.D. Wilson A.A. McMurray I. Dunham J. Rogers D.R. Bentley (2000) Artículo Título Un mapa SNP del cromosoma 22 humano Naturaleza 407 516–520 Identificador de ocurrencia 11029003 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3cXntlSks7w% Identificador de ocurrencia 3D 000089727400051

D.B. Neale O. Savolainen (2004) Artículo Título Asociación genética de rasgos complejos en coníferas Tendencias Plant Sci. 9 325-330 Mango de ocurrencia 10.1016 / j.tplants.2004.05.006 Mango de ocurrencia 15231277 Mango de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXlsVSnur8% 3D

M. Nordborg J.O. Borevitz J. Bergelson C.C. Berry J. Chory J. Hagenblad M. Kreitman J.N. Maloof T. Noyes P. Oefner E.A. Stahl D. Weigel (2002) Artículo Título El grado de desequilibrio de eslabonamiento en Arabidopsis thaliana Nature Genet. 30 190-193 Identificador de ocurrencia 10.1038 / ng813 Identificador de ocurrencia 11780140 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38XhtFWltLo% 3D

M. Nordborg S. Tavaré (2002) Artículo Título Desequilibrio de vinculación: ¿qué nos tiene que contar la historia? Tendencias. Gineta. 18 83–90 Identificador de ocurrencia 10.1016 / S0168-9525 (02) 02557-X Identificador de ocurrencia 11818140 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38XovFantQ% 3D% 3D

M. Nothnagel R. Fürst K. Rohde (2002) Artículo Título La entropía como medida del desequilibrio de ligamiento sobre bloques de haplotipos multilocus Tararear. Hered. 54 186-198 Identificador de sucesos 10.1159 / 000070664 Identificador de sucesos 12771551 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXktVKntbY% 3D

Nothnagel M., Rohde K., Yu F., Willis T., Pasternak S., Hardenbol P., Belmont J., Leal S.M., Gibbs R.A. (2004). Definición de bloques de haplotipos basados ​​en evaluación LD multilocus. En: Novena Reunión Internacional del Genoma Humano, Centro de Convenciones Estrel, Berlín, Alemania, 4 a 7 de abril, P239

K.M. Olsen S.S. Halldorsdottir J.R. Stinchcombe C. Weinig J. Schmitt M.D. Purugganan (2004) Artículo Título Mapeo de desequilibrio de vinculación de Arabidopsis CRY2alelos del tiempo de floración Genética 167 1361-1369 Mango de ocurrencia 10.1534 / genetics.103.024950 Mango de ocurrencia 15280248 Mango de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXnt1Gju7s% 3D Mango de ocurrencia 000223109300028

Owens C.L. (2003a). Detección de SNP y genotipado en Vitis. En: E. Hajdu y E. Borbas (Eds.) VIII Congreso Internacional sobre Genética y Mejoramiento de la Uva

Owens C.L. (2003b). http://www.ars.usda.gov/research/projects/projects.htm?ACCN _NO = 407003 & ampshowpars = true & ampfy = 2003

Owens C.L. (2004). Combinando análisis de ligamiento y mapeo de desequilibrio de ligamiento para diseccionar la genética del color de la fruta en la vid. En: Séptimo Simposio Internacional sobre Fisiología y Biotecnología de la Vid, 21-25 de junio, Universidad de California, Davis, California, EE. UU.

B. Padhukasahasram P. Marjoram M. Nordborg (2004) Artículo Título Estimación de la tasa de conversión genética en el cromosoma 21 humano Soy. J. Hum. Gineta. 75 386–397 Identificador de ocurrencias 10.1086 / 423451 Identificador de ocurrencias 15250027 Identificador de ocurrencias 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXnt1Wgt7s% 3D

K. Palaisa M. Morgante S. Tingey A. Rafalski (2004) Artículo Título Patrones a largo plazo de diversidad y desequilibrio de vínculos que rodean al maíz Y1 gen son indicativos de un barrido selectivo asimétrico Proc. Natl. Acad. Sci. ESTADOS UNIDOS. 101 9885–9890 Identificador de sucesos 10.1073 / pnas.0307839101 Identificador de sucesos 15161968 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXlvVahtbs% 3D

K.A. Palaisa M. Morgante M. Williams A. Rafalski (2003) Artículo Título Efectos contrastantes de la selección sobre la diversidad de secuencias y el desequilibrio de ligamiento en dos loci de fitoeno sintasa Célula vegetal 15 1795–1806 Identificador de ocurrencia 10.1105 / tpc.012526 Identificador de ocurrencia 12897253 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXms1WlsLc% Identificador de ocurrencia 3D 000184867100010

A.H. Paterson Y.-R. Lin Z. Li K.F. Schertz J.F. Doebley S.R.M. Pinson S.-C. Liu J.W. Stansel J.E. Irvine (1995) Artículo Título Domesticación convergente de cultivos de cereales por mutaciones independientes en los loci genéticos correspondientes Ciencias 269 1714–1718 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK2MXot1aitbg% Identificador de ocurrencia 3D A1995RV94800036 Identificador de ocurrencia 17821643

J. Peng Y. Ronin T. Fahima M.S. Röder Y. Li E. Nevo A. Korol (2003) Artículo Título Domesticación loci de rasgos cuantitativos en Triticum dicoccoides, el progenitor del trigo Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 100 2489–2494 Identificador de sucesos 12604784 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXitVais78% 3D

C. Pozzi L. Rossini A. Vacchietti F. Salamini (2004) Cambios genéticos y genómicos durante la domesticación de cereales P.K. Gupta R.K. Varshney (Eds) Cereal Genomics. Kluwer Academic The Netherlands 165–198

J.K. Pritchard M. Stephens N.A. Rosenberg P. Donnelly (2000) Artículo Título Mapeo de asociaciones en poblaciones estructuradas Soy. J. Hum. Gineta. 37 170–181

M.D. Purugganan J.L. Suddith (1999) Artículo Título Genética de poblaciones moleculares de loci homeóticos florales: desviaciones del modelo de equilibrio neutro en el APETALA3 y PISTILLATA genes de Arabidopsis thaliana Genética 151 839–848 Identificador de ocurrencia 9927474 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK1MXhtlCgsL4% Identificador de ocurrencia 3D 000078462500036

A. Rafalski (2002) Artículo Título Aplicaciones de polimorfismos de un solo nucleótido en genética de cultivos Curr. Opin. Plant Biol. 5 94-100 Identificador de sucesos 10.1016 / S1369-5266 (02) 00240-6 Identificador de sucesos 11856602 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD38XhtlGnsLg% 3D

A. Rafalski M. Morgante (2004) Artículo Título Maíz y humanos: desequilibrio de recombinación y ligamiento en dos genomas de tamaño similar Trends Genet. 20 103-111 Identificador de ocurrencia 10.1016 / j.tig.2003.12.002 Identificador de ocurrencia 14746992 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXmvFyhuw% 3D% 3D

Ramsay L., Russell J., Macaulay M., Thomas W.T.B., Powell W., Waugh R. (2004). Desequilibrio de ligamiento en cebada europea. En: 9º Simposio Internacional de Genética de la Cebada (IBGS), 20-26 de junio, Brnö, República Checa

Rawat A. (2004). Relación entre variedades étnicas de Zea mays de Asia, África y América Latina. Tesis doctoral, Universidad Jawaharlal Nehru, Nueva Delhi, India

DELAWARE. Reich M. Cargill S. Bolk J. Ireland P.C. Sabeti D. Richter T. Lavery R. Kouyoumjian S.F. Farhadian R. Ward E.S. Lander (2001) Artículo Título Desequilibrio de vinculación en el genoma humano Naturaleza 411 199–204 Identificador de sucesos 10.1038 / 35075590 Identificador de sucesos 11346797 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXjslGlur0% 3D Identificador de sucesos 000168563000052

D.L. Remington J.M. Thornsberry Y. Matsuoka L.M. Wilson S.R. Whitt J. Doebley S. Kresovich M.M. Goodman E.S. IV. Buckler (2001) Artículo Título Estructura del desequilibrio de ligamiento y asociaciones fenotípicas en el genoma del maíz Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 98 11479–11484 Identificador de ocurrencia 10.1073 / pnas.201394398 Identificador de ocurrencia 11562485 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXnt1yqu7s% 3D

N.A. Rosenberg J.K. Pritchard J.L. Weber H.M. Cann K.K. Kidd L.A. Zhivotovsky M.W. Feldman (2002) Artículo Título Estructura genética de las poblaciones humanas Ciencias 298 2381–2385 Identificador de ocurrencia 12493913 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38Xps1Sju74% Identificador de ocurrencia 3D 000179915900054

J. Russell A. Booth J. Fuller B. Harrower P. Hedley G. Machray W. Powell (2004) Artículo Título Una comparación del polimorfismo basado en secuencias y el contenido de haplotipos en regiones transcritas y anónimas del genoma de la cebada Genoma 47 389–398 Identificador de ocurrencia 15060592 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXksFOrsb4% Identificador de ocurrencia 3D 000221105200018 Identificador de ocurrencia 10.1139 / g03-125

SUDOESTE. Schaeffer M.P. Goetting-Minesky M. Kovacevic J.R. Peoples J.L. Graybill J.M. Miller K. Kim J.G. Nelson W.W. Anderson (2003) Artículo Título Genómica evolutiva de las inversiones en Drosophila pseudoobscura: evidencia de epistasis Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 100 8319–8324 Identificador de ocurrencias 10.1073 / pnas.1432900100 Identificador de ocurrencias 12824467 Identificador de ocurrencias 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXlsFGnt74% 3D

C. Schlotterer (2003) Artículo Título Mapeo de autostop: genómica funcional desde la perspectiva de la genética de poblaciones Trends Genet. 19 32-38 Identificador de sucesos 10.1016 / S0168-9525 (02) 00012-4 Identificador de sucesos 12493246 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD38XpsFaqtLs% 3D

S.K. Servicio D.W. Lang N.B. Freimer L.A. Sandkuijl (1999) Artículo Título Mapeo de vínculos-desequilibrio de genes de enfermedades mediante la reconstrucción de haplotipos ancestrales en poblaciones fundadoras Soy. J. Hum. Gineta. 64 1728–1738 Identificador de ocurrencia 10.1086 / 302398 Identificador de ocurrencia 10330361 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK1MXltlOgurw% 3D

K.A. Shepard M.D. Purugganan (2003) Artículo Título Genética de poblaciones moleculares del Arabidopsis CLAVATA2 región: la escala genómica de variación y selección en una especie autofecundada Genética 163 1083-1095 Identificador de ocurrencia 12663546 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXjtlOgsL4% Identificador de ocurrencia 3D 000182046900021

I. Simko (2004) Artículo Título Una papa, dos papa: mapeo de asociación de haplotipos en autotetraploides Tendencias Plant Sci. 9 441–448 Mango de ocurrencia 10.1016 / j.tplants.2004.07.003 Mango de ocurrencia 15337494 Mango de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXntVOjt7s% 3D

I. Simko S. Costanzo K.G. Haynes B.J. Chris R.W. Jones (2004a) Artículo Título Mapeo de desequilibrio de vínculo de un Verticillium dahliae locus de rasgo cuantitativo de resistencia en papa tetraploide Solanum tuberosum a través de un enfoque de genes candidatos Theor. Apl. Gineta. 108 217–224 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXjtFCntQ% 3D% 3D

I. Simko K.G. Haynes E.E. Ewing S Costanzo B.J. Christ R.W. Jones (2004b) Artículo Título Mapeo de genes para la resistencia a Verticillium albo-atrum en poblaciones de papa tetraploide y diploide mediante pruebas de asociación de haplotipos y análisis genético Mol. Gineta. Genómica 271 522–531 Identificador de ocurrencia 10.1007 / s00438-004-1010-z Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXks1KmtL8% 3D

Skøt L., Humpherys M., Heywood S., Sanderson R., Armstead I., Thomas I., Chorlton K., Hamilton R.S. (2004). La aplicación de la genecología al descubrimiento de asociaciones entre fenotipos y marcadores moleculares en poblaciones naturales de raigrás perenne. En: XII Conferencia Plant & amp Animal Genomes, del 10 al 14 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, W137

M. Slatkin L. Excoffier (1996) Artículo Título Prueba de desequilibrio de ligamiento en datos genotípicos utilizando el algoritmo de maximización de expectativas Herencia 76 377–383 Identificador de sucesos 8626222 Identificador de sucesos A1996UF37400007

R.S. Spielman W.J. Ewens (1996) Artículo Título La TDT y otras pruebas familiares para el desequilibrio de ligamiento y la asociación Soy. J. Hum. Gineta. 59 983–989 Identificador de ocurrencia 8900224 Identificador de ocurrencia 1: STN: 280: DyaK2s% 2FlsFykug% 3D% 3D

R.S. Spielman R.E. McGinnis W.J. Ewens (1993) Artículo Título Prueba de transmisión para el desequilibrio de ligamiento: la región del gen de la insulina y la diabetes mellitus insulinodependiente (IDDM) Soy. J. Hum. Gineta. 52 506–513 Identificador de sucesos 8447318 Identificador de sucesos 1: STN: 280: DyaK3s7ptV2rsA% 3D% 3D

E.A. Stahl G. Dwyer R. Mauricio M. Kreitman J. Bargelson (1999) Artículo Título Dinámica del polimorfismo de resistencia a enfermedades en el Rpm1 locus de Arabidopsis Naturaleza 400 667–671 Identificador de ocurrencia 10458161 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK1MXlsVCktb8% Identificador de ocurrencia 3D 000082032900054

Stracke, S., Perovic, D., Stein, N., Thiel, T. y Graner, A. 2003. Desequilibrio de ligamiento en cebada. XI Simposio de Marcadores Moleculares de la GPZ: http://meetings.ipk-gatersleben.de/moma2003/index.php

C.W. Stuber M. Polacco M.L. Senior (1999) Artículo Título Sinergia de mejoramiento empírico, selección asistida por marcadores y genómica para aumentar el potencial de rendimiento de los cultivos Crop Sci. 39 1571-1583 Manija de ocurrencia 10.2135 / cropci1999.3961571x

P. Taillon-Miller I. Bauer-Sardina N.L. Saccone J. Putzel T. Laitinen A. Cao J. Kere G. Pilia J.P. Rice P.Y. Kwok (2000) Artículo Título Regiones yuxtapuestas de desequilibrio de ligamiento mínimo y extenso en humanos Xq25 y Xq28 Nat. Gineta. 25 324–328 Identificador de sucesos 10888883 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3cXkvFKksbk% 3D

P. Taillon-Miller Z. Gu Q. Li L. Hillier P.Y. Kwok (1998) Artículo Título Secuencias genómicas superpuestas: un tesoro de polimorfismos de un solo nucleótido Genome Res. 8 748–754 Identificador de sucesos 9685323 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DyaK1cXltFeltr0% 3D

F. Tajima (1989) Artículo Título Método estadístico para probar la hipótesis mutacional neutra por polimorfismo de ADN Genética 123 585–595 Identificador de ocurrencia 2513255 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK3cXhslentA% 3D% 3D Identificador de ocurrencia A1989AX26700018

MI. Tenaillon M.C. Sawkins L.K. Anderson SM Stack J. Doebley B.S. Gaut (2002) Artículo Patrones de título de diversidad y recombinación a lo largo del cromosoma 1 del maíz (Zea maysssp. maysL.) Genética 162 1401–1413 Identificador de ocurrencia 12454083 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38XpslCisrs% Identificador de ocurrencia 3D 000179739900034

MI. Tenaillon M.C. Sawkins A.D. Long R.L. Gaut J.F. Doebley B.S. Gaut (2001) Artículo Título Patrones del polimorfismo de la secuencia de ADN a lo largo del cromosoma 1 del maíz (Zea mays ssp. mays L.) Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 98 9161–9166 Identificador de ocurrencia 10.1073 / pnas.151244298 Identificador de ocurrencia 11470895 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXlvFSku7k% 3D

MI. Tenaillon J. U’Ren O. Tenaillon B.S. Gaut (2004) Artículo Selección de título versus demografía: una investigación multilocosa del proceso de domesticación del maíz Mol. Biol. Evol. 21 1214-1225 Identificador de sucesos 15014173 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD2cXltlKlsrk% 3D

J.D. Terwilliger (1995) ArticleTitle Un poderoso método de verosimilitud para el análisis del desequilibrio de ligamiento entre loci de rasgos y uno o más loci de marcadores polimórficos Soy. J. Hum. Gineta. 56 777–787 Identificador de ocurrencia 7887434 Identificador de ocurrencia 1: STN: 280: DyaK2M7ptlyjug% 3D% 3D

J.D. Terwilliger K.M. Weiss (1998) Artículo Título Mapeo del desequilibrio de vinculación de enfermedades complejas: ¿fantasía o realidad? Curr. Opin. Biotecnología. 9 578–594 Identificador de ocurrencia 9889136 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DyaK1MXisVOgtg% 3D% 3D

InstitutionalAuthorName The International HapMap Consortium (2003) ArticleTitle El proyecto internacional HapMap Naturaleza 426 789–796

J.M. Thornsberry M.M. Goodman J. Doebley S. Kresovich D. Nielsen E.S.IV. Buckler (2001) Artículo Título Enano8 Los polimorfismos se asocian con la variación en el tiempo de floración. Nature Genet. 28 286–289 Identificador de ocurrencias 10.1038 / 90135 Identificador de ocurrencias 11431702 Identificador de ocurrencias 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXltFSmurc% 3D

D. Tian H. Araki E. Stahl J. Bergelson M. Kreitman (2002) Artículo Título Firma de la selección de equilibrio en Arabidopsis Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 99 11525–11530 Identificador de sucesos 12172007 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD38XmslSls7k% 3D

S.A. Tishkoff B.C. Verrelli (2003) Artículo Título Papel de la historia evolutiva en la estructura de bloques de haplotipos en el genoma humano: implicaciones para el mapeo de enfermedades Curr. Opin. Gineta. Desarrollar. 13 569–575 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXpt1SnsL0% 3D

van der Voort J.R., Sorensen A., Lensink D., Van der Meulen M., Michelmore R., Peleman J. (2004). Decaimiento del desequilibrio de ligamiento en el dm3 grupo de genes de resistencia de lechuga. En: XII Conferencia Plant & amp Animal Genomes, 10-14 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, P748. páginas

D. Verhaegen C. Plomion M. Poitel P. Costa A. Kremer (1998) Artículo Título Análisis de disección de rasgos cuantitativos en eucalipto utilizando marcadores RAPD: 2. desequilibrio de ligamiento en un diseño factorial entre E. urophylla y E. grandis Forest Genet. 5 61–69

Y. Vigouroux M. McMullen C.T. Hittinger K. Houchins L. Schulz S. Kresovich Y. Matsuoka J. Doebley (2002) Artículo Título Identificación de genes de importancia agronómica en el maíz mediante el cribado de microsatélites en busca de evidencias de selección durante la domesticación Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 99 9650–9655 Identificador de ocurrencias 10.1073 / pnas.112324299 Identificador de ocurrencias 12105270 Identificador de ocurrencias 1: CAS: 528: DC% 2BD38XlslKhurc% 3D

D.L. Wang J. Zhu Z.K. Li A.H. Paterson (1999) Artículo Título Mapeo de QTL con efectos epistáticos e interacciones QTL × medio ambiente mediante enfoques de modelos lineales mixtos Theor. Apl. Gineta. 99 1255–1264 Identificador de sucesos 10.1007 / s001220051331

B.S. Weir (1996) Análisis de datos genéticos II Sinauer Sunderland, MA, EE. UU.

K.M. Weiss A.G. Clark (2002) Artículo Título Desequilibrio de vinculación y mapeo de rasgos humanos complejos Trends Genet. 18 19-24 Identificador de sucesos 10.1016 / S0168-9525 (01) 02550-1 Identificador de sucesos 11750696 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3MXpt1agsr8% 3D

Wilcox P.L., Cato S., Ball R.D., Kumar S., Lee J.R., Kent J., Richardson T.E., Echt C.S. (2002). Arquitectura genética de la densidad de la madera juvenil en Pinus radiata e implicaciones para el diseño de estudios de desequilibrio de ligamiento. En: X Conferencia Plant, Animal & amp Microbe Genomes, 12-16 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA

Wilcox P.L., Cato S., McMillan L.K., Power M., Ball R.D., Burdon R.D., Echt C.S. (2004). Patrones de desequilibrio de ligamiento en Pinus radiata. En: XII Conferencia Plant & amp Animal Genomes, del 10 al 14 de enero, Town & amp Country Convention Center, San Diego, CA, W89

R. Wu C.-X. Ma G. Casella (2002) Artículo Título Mapeo conjunto de vínculos y desequilibrios de vínculos de loci de rasgos cuantitativos en poblaciones naturales Genética 160 779–792 Identificador de ocurrencia 11861578 Identificador de ocurrencia 1: CAS: 528: DC% 2BD38XitlWrsLc% Identificador de ocurrencia 3D 000174097600037

R. Wu Z.-B. Zeng (2001) Artículo Título Mapeo conjunto de vínculos y desequilibrios de vínculos en poblaciones naturales Genética 157 899–909 Identificador de sucesos 11157006 Identificador de sucesos 1: STN: 280: DC% 2BD3M3osFWhuw% 3D% Identificador de sucesos 3D 000166810200040

Y.Z. Xing Y.F. Tan J.P. Hua X.L. Sun C.G. Xu Q. Zhang (2002) Artículo Título Caracterización de los principales efectos, efectos epistáticos y sus interacciones ambientales de los QTL sobre la base genética de los rasgos de rendimiento en arroz Theor. Apl. Gineta. 105 248-257 Identificador de sucesos 12582526 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD38Xntlaqu7o% 3D

M. Xiong S.-W. Guo (1997) Artículo Título Mapeo genético a escala fina basado en desequilibrio de ligamiento: teoría y aplicaciones Soy. J. Hum. Gineta. 60 1513-1531 Identificador de sucesos 9199574 Identificador de sucesos 1: STN: 280: DyaK2szkt12htQ% 3D% 3D

Y. Yang J. Zhang J. Hoh F. Matsuda P. Xu M. Lathrop J. Ott (2003) Artículo Título Eficiencia de la estimación del haplotipo de polimorfismo de un solo nucleótido a partir de ADN agrupado Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 100 7225–7230 Identificador de sucesos 12777616 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DC% 2BD3sXkslOmsrg% 3D

S.B. Yu J.X. Li C.G. Xu Y.F. Tan Y.J. Gao X.H. Li Q. Zhang M.A. Saghai Maroof (1997) Artículo Título Importancia de la epistasis como base genética de la heterosis en un híbrido de arroz de élite Proc. Natl. Acad. Sci. Estados Unidos 94 9226–9231 Identificador de sucesos 11038567 Identificador de sucesos 1: CAS: 528: DyaK2sXls1Kls7k% 3D

C. Zapata (2000) ArticleTitle La medida D ′ del desequilibrio gamético general entre pares de loci multialélicos Evolución 54 1809–1812 Identificador de ocurrencia 11108607 Identificador de ocurrencia 1: STN: 280: DC% 2BD3MzgsVOkug% 3D% Identificador de ocurrencia 3D 000165471000032


Polimorfismo

Además, la selección natural puede verse limitada por las relaciones entre diferentes polimorfismos. Un morph puede conferir una mayor aptitud que otro, pero puede que no aumente en frecuencia porque el morph intermedio es perjudicial.

Figura ( PageIndex <1> ):

Polimorfismo en el caracol de la arboleda: Morfos de color y patrón del caracol de arboleda, Cepaea nemoralis. El polimorfismo, cuando existen dos o más genotipos diferentes dentro de una especie dada, en los caracoles de arboleda parece tener varias causas, incluida la depredación por zorzales.

Por ejemplo, considere una población hipotética de ratones que viven en el desierto. Algunos son de color claro y se mezclan con la arena, mientras que otros son oscuros y se mezclan con los parches de roca negra. Los ratones de color oscuro pueden estar más en forma que los ratones de color claro y, de acuerdo con los principios de la selección natural, se espera que la frecuencia de los ratones de color claro disminuya con el tiempo. Sin embargo, el fenotipo intermedio de un pelaje de color medio es muy malo para los ratones: estos no pueden mezclarse ni con la arena ni con la roca y serán más vulnerables a los depredadores. Como resultado, la frecuencia de los ratones de color oscuro no aumentaría porque los morfos intermedios son menos aptos que los ratones de color claro o de color oscuro. Este es un ejemplo común de selección disruptiva.


Birley, A. J .: Selección y polimorfismo de múltiples locus en una población de Drosophila melanogaster: I. Desequilibrio de ligamiento en el cromosoma III. Herencia 32, 122–127 (1974).

Bodmer, J., Bodmer, W. F .: Genética de poblaciones del sistema HL-A: resumen de los datos del Quinto Taller Internacional de Pruebas de Histocompatibilidad. Isr. J. Med. Sci. 9, 1257 1268 (1973).

Bodmer, W. F., Felsenstein. J .: Vinculación y selección: Análisis teórico del modelo determinista de apareamiento aleatorio de dos locus. Genética 57, 237–265 (1967).

Cavalli-Sforza, L. L., Bodmer, W. F .: La genética de las poblaciones humanas, 965 p. San Francisco, Estados Unidos: W. H. Freeman and Co. 1971.

Charlesworth, B., Chariesworth, D .: Un estudio del desequilibrio de ligamiento en poblaciones de Drosophila melanogaster. Genética 73, 351–359 (1973).

Ewens, W. J .: Un modelo genético que tiene un comportamiento de ligamiento complejo. Theor. Apl. Gineta. 1, 140–143 (1968).

Feldman, M. W., Franklin, I. R., Thomson, G .: Selección en sistemas genéticos complejos: I. Los equilibrios simétricos del modelo de viabilidad simétrica de tres locus. Genética 76, 135–162 (1974).

Feldman, M. W., Lewontin, R. C., Franklin, I. R., Christiansen, F. B .: Selección en sistemas genéticos complejos: III. Un efecto de multiplicidad de alelos con dos loci. Genética 79, 333–347 (1975).

Karlin, S., Feldman, M. W .: Vinculación y selección: modelo de viabilidad simétrica de dos locus. Theoret. Música pop. Biol. 1, 39–71 (1970).

Karlin, S., McGregor, J. L .: Polimorfismos para sistemas genéticos y ecológicos con acoplamiento débil. Theoret. Música pop. Biol. 3, 210–238 (1972).

Kingman, J. F. C .: Un problema matemático en genética de poblaciones. Proc. Cambridge Phil. Soc. 57, 574–582 (1961).

Lewontin, R. C., Kojima, K .: La dinámica evolutiva de polimorfismos complejos. Amer. Natur. 59, 281–296 (1960).

Mandel, S. P. H .: Estabilidad de un sistema alélico múltiple. Herencia 13, 289–302 (1959).

Roberts, R. M., Baker, W. K .: Distribución de frecuencias y desequilibrio de ligamiento de isoenzimas esterasas activas y nulas en poblaciones naturales de Drosophila montana. Amer. Natur. 107, 709–726 (1973).

Roux, C. Z .: Cargas genéticas: I. Equilibrios de Hardy Weinberg en poblaciones de apareamiento al azar. Theoret. Música pop. Biol. 5 (1974).


Discusión

Hemos demostrado que los registros genéticos pueden potencialmente vincularse incluso si contienen conjuntos de marcadores que no se superponen. A pesar del pequeño número de marcadores en uno de nuestros conjuntos de datos (13 STR), los perfiles de múltiples marcadores se pueden emparejar con los perfiles de SNP de todo el genoma con una mediana de precisión superior al 90% (Tabla 1). Además, la precisión de coincidencia de registros aumenta con el número de marcadores, y con solo unas pocas docenas de marcadores, la precisión se acerca al 100% (Fig. 4).

El hecho de que se puedan lograr precisiones de coincidencia tan altas a pesar de las precisiones de imputación relativamente bajas en STR individuales es quizás sorprendente. En ganado domesticado, McClure et al. (22) observaron que los haplotipos de SNP son altamente predictivos del alelo de un STR que se encuentra dentro del haplotipo y que, por lo tanto, los perfiles de STR podrían imputarse con gran precisión. En humanos, sin embargo, LD entre STR y SNP circundantes es más débil, con muchos alelos STR distintos que aparecen en el mismo haplotipo SNP en una población y con múltiples haplotipos SNP que poseen el mismo alelo STR (8, 9). Sin embargo, debido a que existe algo de LD y debido a que las precisiones de imputación basadas en SNP exceden las precisiones de imputación nula, la información de LD se puede acumular a través de marcadores para permitir la coincidencia de registros, de manera similar a la manera en que pequeñas diferencias en la frecuencia de alelos entre poblaciones se pueden acumular a través de marcadores para habilitar la inferencia de ascendencia (27, 28).

La precisión de la imputación se correlaciona negativamente con las medidas de diversidad genética en las muestras en las que se imputan los genotipos y, por lo tanto, a menudo es mayor en poblaciones de baja diversidad que en poblaciones de alta diversidad (24, 29). Aquí, este efecto se acumula en todos los loci, y las puntuaciones medias de coincidencia son, por lo tanto, mayores para las coincidencias en los nativos americanos de baja heterocigosidad que en los africanos de alta heterocigosidad (Tabla S3). Sin embargo, el aumento en las puntuaciones de coincidencia también se aplica a los pares que no coinciden en poblaciones de baja diversidad, porque la mayor similitud entre los individuos de dichas poblaciones aumenta la puntuación media de coincidencia para estos pares (Fig. 2). Debido a que los puntajes de coincidencia se inflan en poblaciones de baja diversidad tanto para coincidencias como para no coincidencias, las diferencias entre las puntuaciones medias de coincidencia para coincidencias y no coincidencias son similares entre los grupos, por lo que el potencial para separar las coincidencias de las no coincidencias no tiene por qué ser mayor en los grupos de baja diversidad (Tabla S3).

Puntuaciones medias de coincidencia para pares de individuos coincidentes y no coincidentes subdivididos por región geográfica

Nuestro estudio se suma a una lista creciente de escenarios de coincidencia de registros en genética. Vohr y col. (30) utilizaron SNP para calcular puntuaciones de coincidencia basadas en la razón de verosimilitud, basándose en un panel de referencia por fases para ayudar a asignar lecturas de secuencia de baja cobertura a la misma persona. También se han utilizado métodos conceptualmente similares para identificar desajustes entre genotipos y datos de expresión (31, 32). Nuestro método aumenta este trabajo utilizando el marco de comparación de registros y permitiendo coincidencias entre marcadores de diferentes tipos, incluso cuando la precisión de imputación está muy por debajo de uno.

El hecho de que las precisiones de imputación de CODIS sean relativamente bajas (Fig. 1) sugiere que, a partir de un perfil de SNP, es poco probable que se pueda imputar de forma fiable el perfil de CODIS STR completo de un individuo. Sin embargo, si ese perfil ya aparece en una base de datos CODIS STR, entonces podría ser posible identificar una coincidencia entre el perfil SNP y su perfil STR asociado. La viabilidad de la comparación de registros sugiere una forma de compatibilidad con versiones anteriores de la base de datos CODIS STR, en la que los perfiles de SNP en lugar de STR se recopilarían en muestras futuras y se consultarían en las bases de datos de SNP nuevas y los datos de STR existentes. Luego, los STR podrían teclearse en tales muestras para validar una coincidencia STR-STR solo si se sugiere una coincidencia SNP-STR fuerte. Aunque la precisión de la coincidencia fue imperfecta, el hecho de que los umbrales estrictos de puntuación de coincidencia permitieran muchas coincidencias precisas antes de que se cometiera el primer error sugiere que la compatibilidad con versiones anteriores mediante la coincidencia de registros y la exclusión de emparejamientos poco probables puede lograrse para una fracción sustancial de las muestras.

La utilidad de la coincidencia de registros en el avance de la genética forense depende del grado en que se escala a los tamaños típicos de conjuntos de datos forenses, que se cuentan en miles o millones de perfiles. Descubrimos que la precisión de la coincidencia de registros aumenta a medida que se encuentran disponibles conjuntos de entrenamiento más grandes, pero disminuye con el tamaño del conjunto de prueba. Un aumento en el número de loci CODIS de 13 a 20 (15) aumenta el potencial de precisión de coincidencia de registros fue considerablemente mayor en nuestros escenarios de 20-STR que en los ejemplos de CODIS de 13-STR 4 loci en la actualización de 2017 de los marcadores CODIS son disponible en los datos de ref. 12, y combinarlos con el conjunto de 13 locus proporciona un aumento sustancial de la precisión (Tabla 1). Esperamos que la precisión podría aumentar aún más si los genotipos STR se produjeran mediante un procedimiento que obtenga la secuencia de ADN completa de los STR en lugar de la longitud de la unidad repetida, subdividiendo así los alelos de longitud repetida en clases alélicas más finas (33, 34) con este enfoque, el nivel de resolución en el que los alelos se clasifican como distintos podría ajustarse a un nivel que maximice la precisión de coincidencia de registros.

Incluso con conjuntos de prueba bastante grandes, es plausible que algunos perfiles puedan emparejarse con gran confianza. Si el partido puntúa λ (R i, S j) de la Ec. 1 se ven como razones de probabilidad, luego según la regla de Bayes, O [(M = 1): (M = 0) | λ (R i, S j)] = O [(M = 1): (M = 0)] exp [λ (R i, S j)], [3] donde O indica probabilidades. Eq. 3 se puede utilizar para determinar la puntuación de coincidencia necesaria para obtener una probabilidad posterior especificada y, por lo tanto, la probabilidad posterior de una coincidencia dadas las probabilidades anteriores de una coincidencia. Para obtener probabilidades posteriores de una coincidencia & gt10 (es decir, probabilidad posterior & gt10 / 11), con probabilidades previas de 4,3 × 10 −9 (1 en 235 millones, la población adulta aproximada de los Estados Unidos en el censo de 2010), una puntuación de coincidencia debe exceder ln [10 / (4,3 × 10 - 9)] ≈ 21,6. Cuando aplicamos nuestro método utilizando 13 marcadores CODIS en la partición que conduce a una precisión media de coincidencia uno a uno con 654 personas en el conjunto de entrenamiento, 1 de 218 puntuaciones de coincidencia verdaderas en el conjunto de prueba supera este umbral, lo que equivale a 21,8. Sin embargo, cuando incluimos cuatro marcadores nuevos del panel CODIS actualizado, 17 de 218 (7,8%) puntuaciones de coincidencia real superan el umbral (puntuación máxima de 31,9). Por lo tanto, con el conjunto CODIS expandido, es posible que una proporción no trivial de genotipos CODIS y SNP puedan emparejarse con alta confianza, además, debido a que el tamaño del conjunto de entrenamiento aumenta la precisión de emparejamiento (Fig. S2), esta proporción podría aumentar con un aumento en tamaño del conjunto de entrenamiento. Nuestros cálculos con Eq. 3 motivar la evaluación empírica detallada en conjuntos de datos más grandes.

El potencial para la coincidencia de registros de perfiles SNP y CODIS STR, especialmente con paneles CODIS aumentados, descubre nuevos riesgos para la privacidad. Algunos emparejamientos de registros tienen puntuaciones de coincidencia tan grandes que son improbables en ausencia de una coincidencia real. Por lo tanto, los analistas autorizados o no autorizados equipados con dos conjuntos de datos, uno con genotipos SNP y otro con genotipos CODIS, posiblemente podrían identificar algunos pares de registros que probablemente representen a la misma persona. Para las personas con registros vinculados de esta manera, los genotipos CODIS revelarían genotipos SNP genómicos que, a su vez, podrían revelar mucha más información que los propios genotipos CODIS, como estimaciones precisas de ascendencia, información de salud e identificación que acompaña a los registros SNP y predicciones de fenotipos genéticamente influenciados. En este sentido, contrariamente a la opinión de que los genotipos CODIS no exponen fenotipos (17, 20, 21), un perfil CODIS en una persona junto con una base de datos SNP, si la persona está en la base de datos, en principio puede contener todos los fenotipos información que se puede predecir de manera confiable a partir del registro SNP. Por el contrario, los participantes en una investigación biomédica o genómica personal que hayan dado su consentimiento para compartir sus genotipos de SNP pueden estar sujetos a un riesgo que antes no se apreciaba: la identificación en una base de datos forense de STR.

Al igual que en otras situaciones en las que la agregación de datos puede revelar inesperadamente información genética a nivel individual (35 ⇓ –37), es deseable reevaluar la privacidad de los perfiles de STR forenses a la luz de la amplia disponibilidad de diversos perfiles de SNP para los investigadores y el público. . Debido a que nuestros métodos de comparación de registros pueden extenderse más allá de la detección de personas idénticas a la detección de parientes (emparejando un perfil SNP de un individuo con un perfil STR de un familiar), esperamos que las consideraciones de privacidad se extiendan también a este escenario.


Vinculación de genes: características, fases y tipos | Genética

En este artículo discutiremos sobre: ​​- 1. Significado del enlace de genes 2. Características de la vinculación de genes 3. Fases 4. Tipos 5. Grupos de vinculación 6. Detección 7. Vinculación y pleiotropía 8. Importancia de la vinculación en el fitomejoramiento.

  1. Significado del enlace de genes
  2. Características del enlace de genes
  3. Fases del enlace de genes
  4. Tipos de enlace de genes
  5. Grupos de vinculación
  6. Detección del enlace de genes
  7. Vinculación y pleiotropía
  8. Importancia de la vinculación en el fitomejoramiento

1. Significado del enlace de genes:

Unos años después del redescubrimiento de las leyes de herencia de Mendel, Bateson y Punnett (1905) observaron en el guisante de olor que dos pares de alelos no se clasifican de forma independiente. Morgan (1910) encontró el mismo fenómeno en Drosophila y Hutchinson observó un caso claro de ligamiento en el maíz.

Todas estas investigaciones encontraron que los genes heredan en grupos en lugar de individualmente. Esta tendencia de dos o más genes a permanecer juntos en el mismo cromosoma durante la herencia se denomina ligamiento. En otras palabras, el ligamiento es la tendencia de los genes a heredarse en grupos.

2. Características del enlace de genes:

Las principales características de la vinculación se dan a continuación:

1. El ligamiento involucra dos o más genes que están ubicados en el mismo cromosoma de forma lineal.

2. El ligamiento puede involucrar genes dominantes o genes recesivos o algunos genes dominantes y algunos recesivos.

3. El ligamiento generalmente involucra a aquellos genes que están localizados de cerca.

4. La presencia de ligamiento conduce a una mayor frecuencia de tipos parentales que los recombinantes en una progenie cruzada de prueba. Cuando dos genes están ligados, la proporción de segregación de una progenie cruzada de prueba se desvía significativamente de la proporción 1: 1: 1: 1.

5. El vínculo puede involucrar dos o más rasgos deseables o todos los rasgos indeseables o algunos rasgos deseables y algunos indeseables.

6. Se observa un enlace tanto para los rasgos oligogénicos como para los rasgos poligénicos. Sin embargo, es más común para los primeros que para los segundos.

7. Además de la pleiotropía, el ligamiento es una causa importante de correlación genética entre varios caracteres vegetales.

8. La fuerza del enlace depende de la distancia entre los genes enlazados. A menor distancia mayor fuerza y ​​viceversa.

9. Si no ocurre el cruce, se espera que todos los genes ubicados en un cromosoma se hereden juntos. Por tanto, el número máximo de grupos de ligamiento en un organismo es igual a su número de cromosomas haploides.

10. La vinculación se puede romper mediante el cruzamiento repetido de plantas seleccionadas al azar en poblaciones segregantes durante varias generaciones.

3. Fases del enlace de genes:

Hay dos fases de enlace, a saber, fase de acoplamiento y fase de repulsión. Estas fases fueron dadas por Bateson y Punett (1905), pero no pudieron dar una interpretación adecuada de estos términos.

Posteriormente, Morgan (1910) basándose en sus estudios con Drosophila explicó que el acoplamiento y la repulsión son los dos aspectos de un mismo fenómeno que llamamos ligamiento. Las fases de acoplamiento y repulsión del enlace se describen brevemente a continuación.

El vínculo entre dos o más alelos dominantes (AB) o recesivos (ab) se denomina acoplamiento. Hutchinson informó de un buen ejemplo de acoplamiento en el maíz para los genes que gobiernan el color de la semilla (coloreada e incolora) y la forma de la semilla (llena y encogida).

La semilla coloreada está gobernada por el gen dominante (C) y la semilla completa también está gobernada por el gen dominante (S). Hizo un cruce entre plantas que tienen semillas llenas de color (CCSS) y semillas encogidas incoloras (ccss). La F1 las semillas estaban llenas de color. Cuando la F1 En el ensayo cruzado con parental doble recesivo, se obtuvieron los siguientes resultados en lugar de la proporción 1: 1: 1: 1.

Esto indica que las combinaciones parentales son más altas que las recombinaciones, lo que indica la presencia de ligamiento. Las combinaciones parentales ocurrieron en el 96,4% en lugar del 50% y las recombinaciones fueron el 3,6% en lugar del 50% en este caso. Hay varios otros casos de acoplamiento en otras especies de plantas.

El vínculo del alelo dominante con el del alelo recesivo (Ab o aB) se conoce como repulsión. Hutchinson también observó la fase de repulsión del enlace en el maíz. Observó este tipo de vínculo cuando hizo cruces entre plantas que tenían semillas encogidas de color (Cs) con aquellas que tenían semillas completas incoloras (cS).

En F1 las semillas estaban llenas de color. Al cruzar de F1 con parental doble recesivo se obtuvieron los siguientes resultados en lugar de la proporción 1: 1: 1: 1.

Una vez más, las combinaciones parentales fueron mayores (97,1%) de lo esperado (50%) y las recombinaciones fueron menores (2,9%) de lo esperado (50%). Así, en ambos casos, los genes ligados tienden a permanecer juntos durante la transmisión hereditaria. Haldane (1942) utilizó los términos cis y trans para el acoplamiento y la repulsión, respectivamente.

4. Tipos de enlace de genes:

La vinculación se clasifica generalmente sobre la base de tres criterios, a saber:

(1) Presencia o ausencia de cruce,

(3) El cromosoma involucrado.

Estos se describen brevemente a continuación:

1. Basado en Crossing Over:

La vinculación en la que no ocurre el cruce se conoce como vinculación completa o vinculación absoluta. En otras palabras, cuando solo se obtienen tipos parentales de la progenie cruzada de prueba, se refiere a la vinculación completa. Un buen ejemplo de ligamiento completo es la polilla de seda masculina y femenina de Drosophila.

(ii) Vinculación incompleta:

Si también se produce cierta frecuencia de cruzamiento entre genes vinculados, se conoce como vinculación incompleta. Dicho de otra manera, cuando también se observan recombinaciones en la progenie cruzada de prueba, además de las combinaciones parentales, se refiere a un enlace incompleto. Se ha observado un enlace incompleto en maíz, guisantes, hembras de Drosophila y varios otros organismos.

2. Basado en genes involucrados:

Se refiere al enlace entre genes dominantes o entre genes recesivos. Se ha informado de este vínculo en el guisante, el maíz y varios otros cultivos.

Se refiere al enlace de algunos genes dominantes con algunos genes recesivos. Este tipo de vinculación también se ha observado en el guisante, el maíz y varios otros cultivos.

3. Basado en el cromosoma involucrado:

Se refiere al enlace de dichos genes que se encuentran en cromosomas distintos de los sexuales (autosomas).

(ii) Enlace cromosómico X:

Se refiere al enlace de genes que se encuentran en los cromosomas sexuales.

El grupo de ligamiento se refiere a un grupo de genes que están presentes en un cromosoma. En otras palabras, todos los genes que se encuentran en un cromosoma constituyen un grupo de ligamiento. El número de grupos de vinculación está limitado en cada individuo.

El número máximo de grupos de ligamiento es igual al número de cromosomas haploides de un organismo. Sin embargo, en el caso de especies que tienen cromosomas sexuales diferentes, los grupos de ligamiento son uno más que el número de cromosomas haploides. Por ejemplo, hay diez grupos de ligamiento en el maíz, 7 en el guisante, 7 en la cebada, 4 en Drosophila melanogaster y 23 en el hombre.

Los genes se asignan a varios cromosomas de una especie con la ayuda de análisis de deleción, monosómicos y nulisómicos. Los grupos de ligamiento se asignan a diferentes cromosomas de forma lineal y en la misma secuencia que normalmente se enumeran. Generalmente, una longitud relativa de varios grupos de ligamiento en una especie muestra una estrecha concordancia con la longitud relativa del cromosoma en el que existen.

6. Detección del enlace de genes:

El cruce de prueba es el método más común para detectar el enlace. En este método, la F1 heterocigoto en dos loci (digamos AaBb) se cruza con un padre recesivo doble (aabb) y se examina la proporción fenotípica de la progenie cruzada de prueba.

Si la proporción fenotípica de la prueba cruza la progenie muestra una proporción 1: 1: 1: 1 de genotipos parentales y recombinantes, indica ausencia de ligamiento. Si la frecuencia de los tipos parentales y los tipos recombinantes se desvía significativamente de la relación cruzada de prueba normal de 1: 1: 1: 1, revela la presencia de ligamiento entre dos genes en estudio.

Existe otra forma de detectar la presencia o ausencia de vinculación. El individuo heterocigoto en dos loci (AaBb) se autopoliniza. Si hay un dominio completo en cada locus y no hay epistasis, la proporción de segregación de la progenie será de 9: 3: 3: 1.

La presencia de enlace en la fase de acoplamiento o repulsión conducirá a una desviación significativa de la relación 9: 3: 3: 1. La desviación de los valores observados de la relación esperada se prueba con la ayuda de la prueba% 2.

7. Vinculación y pleiotropía:

Una asociación cercana entre dos o más caracteres puede resultar debido al enlace, pleiotropía o ambos. La pleiotropía se refiere al control de dos o más caracteres por un solo gen. Un vínculo estrecho entre dos loci se puede confundir con pleiotropía.

La única forma de distinguir entre vinculación y pleiotropía es encontrar un producto cruzado entre personajes vinculados. El emparejamiento en poblaciones segregadas puede romper un vínculo estrecho, pero se debe criar una gran población para descubrir el producto cruzado. Si no se encuentra un producto cruzado a pesar de un apareamiento repetido, parece ser el caso de pleiotropía en lugar de ligamiento.

8. Importancia de la vinculación en el fitomejoramiento:

En el fitomejoramiento, la vinculación tiene un impacto de tres formas principales.

Los efectos de la vinculación en el progreso de la selección, las variaciones genéticas y la correlación genética se analizan a continuación:

(i) Efecto sobre la selección:

El enlace entre dos o más loci que controlan diferentes caracteres deseables es ventajoso para un fitomejorador. Porque los alelos deseables ocurrirán juntos con mayor frecuencia en la población segregada de lo que se esperaría con un surtido independiente.

Así, el criador puede obtener fácilmente individuos con alelos deseables para dos caracteres. La vinculación es indeseable cuando los genes deseables e indeseables están unidos entre sí. Para obtener un sargento con alelos deseables, el reproductor tiene que hacer crecer poblaciones más grandes que con loci no ligados.

(ii) Efecto sobre la varianza genética:

Las estimaciones de variaciones genéticas para caracteres cuantitativos están muy influenciadas por la presencia de ligamiento. El desequilibrio de ligamiento influye en la acción de los genes provocando sesgos en las estimaciones de las variaciones genéticas. La vinculación en la fase de repulsión en la población segregada provoca un sesgo hacia arriba en las estimaciones de la varianza de dominancia y un sesgo hacia abajo en las estimaciones de la varianza genética aditiva.

(iii) Efecto sobre la correlación genética:

El ligamiento tiene un gran impacto en la correlación genética. Los personajes vinculados generalmente muestran altos valores de correlación genética y también de co-heredabilidad. Un vínculo entre genes que controlan dos caracteres deseables diferentes ayudará a la mejora simultánea de ambos caracteres. Si no existe un vínculo entre dos personajes deseables, el criador tiene que combinar dichos personajes de dos fuentes diferentes.


Otros archivos y enlaces

  • APA
  • Estándar
  • Harvard
  • Vancouver
  • Autor
  • BIBTEX
  • RIS

Resultado de la investigación: Contribución a la revista ›Artículo› revisión por pares

T1: las interacciones entre los alelos SNP en múltiples loci contribuyen a las diferencias de color de la piel entre sujetos caucasoides y mongoloides

N2: este estudio tuvo como objetivo identificar alelos de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) en múltiples loci asociados con diferencias raciales en el color de la piel mediante la genotipificación de SNP. Un total de 122 caucásicos en Toledo, Ohio y 100 mongoloides en Japón fueron genotipados para 20 SNP en 7 genes candidatos, que codifican la proteína de señalización de Agouti (ASIP), la proteína 1 relacionada con la tirosinasa (TYRP1), la tirosinasa (TYR), el receptor de melanocortina 1 (MC1R), albinismo oculocutáneo II (OCA2), factor de transcripción asociado a microftalmia (MITF) y miosina VA (MYO5A). Los datos se utilizaron para analizar las asociaciones entre los 20 alelos SNP utilizando desequilibrio de ligamiento (LD). Las combinaciones de alelos de SNP se probaron conjuntamente bajo LD para las asociaciones con grupos raciales mediante la realización de una prueba de χ2 para la independencia. Los resultados mostraron que los alelos de SNP en múltiples loci pueden considerarse el haplotipo que contribuye a diferencias significativas entre los dos grupos de población y sugiere una alta probabilidad de LD. La confirmación de estos hallazgos requiere más estudios con otros grupos étnicos para analizar las asociaciones entre los alelos SNP en múltiples loci y la variación del color de la piel entre razas.

AB: este estudio tuvo como objetivo identificar alelos de polimorfismo de nucleótido único (SNP) en múltiples loci asociados con diferencias raciales en el color de la piel mediante el uso de genotipificación de SNP. Un total de 122 caucásicos en Toledo, Ohio y 100 mongoloides en Japón fueron genotipados para 20 SNP en 7 genes candidatos, que codifican la proteína de señalización de Agouti (ASIP), la proteína 1 relacionada con la tirosinasa (TYRP1), la tirosinasa (TYR), el receptor de melanocortina 1 (MC1R), albinismo oculocutáneo II (OCA2), factor de transcripción asociado a microftalmia (MITF) y miosina VA (MYO5A). Los datos se utilizaron para analizar las asociaciones entre los 20 alelos SNP utilizando desequilibrio de ligamiento (LD). Las combinaciones de alelos de SNP se probaron conjuntamente bajo LD para las asociaciones con grupos raciales mediante la realización de una prueba de χ2 para la independencia. Los resultados mostraron que los alelos de SNP en múltiples loci pueden considerarse el haplotipo que contribuye a diferencias significativas entre los dos grupos de población y sugiere una alta probabilidad de LD. La confirmación de estos hallazgos requiere más estudios con otros grupos étnicos para analizar las asociaciones entre los alelos SNP en múltiples loci y la variación del color de la piel entre razas.


El análisis de redes de desequilibrio de ligamiento (LDna) brinda una visión global de las inversiones cromosómicas, la adaptación local y la estructura geográfica

Los avances recientes en la secuenciación permiten generar datos genómicos poblacionales para prácticamente cualquier especie. Sin embargo, los enfoques para analizar dichos datos van a la zaga de la capacidad de generarlos, particularmente en especies que no son modelo. El desequilibrio de ligamiento (LD, la asociación no aleatoria de alelos de diferentes loci) es un indicador muy sensible de muchos fenómenos evolutivos, incluidas las inversiones cromosómicas, la adaptación local y la estructura geográfica. Aquí, presentamos análisis de redes de desequilibrio de ligamiento (LDna), que accede a información sobre LD compartida entre múltiples loci en todo el genoma. En las redes LD, los vértices representan loci y las conexiones entre vértices representan el LD entre ellos. Analizamos dichas redes en dos casos de prueba: un nuevo conjunto de datos de secuencias de ADN asociadas al sitio de restricción (RAD-seq) para Anopheles baimaii, un vector de malaria del sudeste asiático y un conjunto de datos de polimorfismo de nucleótido único (SNP) bien caracterizado de 21 individuos espinosos de tres espinas. En cada caso, identificamos rápidamente cinco grupos de redes de LD distintos (grupos de valores atípicos únicos, SOC), cada uno de los cuales comprende muchos loci conectados por un LD alto. En A. baimaii, análisis de población-genética adicionales apoyaron la inferencia de que cada COS corresponde a una gran inversión, consistente con estudios citológicos previos. Para los espinosos, inferimos que cada SOC se asoció con un fenómeno evolutivo distinto: dos inversiones cromosómicas, adaptación local, historia demográfica de la población y estructura geográfica. Por lo tanto, LDna es una herramienta exploratoria útil, capaz de dar una visión global de LD asociada con diversos fenómenos evolutivos e identificar loci potencialmente involucrados. LDna no requiere un mapa de vinculación o un genoma de referencia, por lo que es aplicable a cualquier conjunto de datos genómicos de población, lo que lo hace especialmente valioso para especies que no son modelo.

Nombre del archivo Descripción
men12369-sup-0001-FigureS1.pdfDocumento PDF, 670 KB Figura S1 Mapa de ubicaciones geográficas de muestreo para Anopheles baimaii.
men12369-sup-0002-FigureS2.pdfDocumento PDF, 384,1 KB Figura S2 Criterio de información bayesiano vs.número de grupos para Anopheles baimaii SOC.
men12369-sup-0003-FigureS3.pdfDocumento PDF, 197,5 KB Figura S3 El efecto de la cantidad de loci en LDna para Anopheles baimaii.
men12369-sup-0004-FigureS4.pdfDocumento PDF, 104,2 KB Figura S4 Diferencias de genotipo entre las poblaciones del Atlántico y del Pacífico para los SOC 618_0.79 y 673_0.76.
men12369-sup-0005-ApéndiceS1.pdfDocumento PDF, 280,6 KB Apéndice S1 Introducción a LDna: conceptos básicos. Tutorial que ofrece una introducción al paquete r "LDna". Se puede encontrar una versión continuamente actualizada en: https://github.com/petrikemppainen/LDna
men12369-sup-0006-ApéndiceS2.pdf Documento PDF, 1,1 MB Apéndice S2 Introducción a LDna: avanzado. Tutorial que explica algunas de las funciones más avanzadas de LDna, incluidas sugerencias sobre cómo encontrar los valores adecuados para los parámetros. φ y |mi|min. Una versión continuamente actualizada está disponible en: https://github.com/petrikemppainen/LDna
men12369-sup-0007-ApéndiceS3.pdfDocumento PDF, 839,8 KB Apéndice S3 Análisis de redes de desequilibrio de enlace (LDna) sobre datos simulados
men12369-sup-0008-ApéndiceS4.pdfDocumento PDF, 65,2 KB Apéndice S4 Anopheles baimaii Conjunto de datos de secuencias RAD y preparación de conjuntos de datos de SNP de tres espinosos espinosos
men12369-sup-0009-ApéndiceS5.pdfDocumento PDF, 778,5 KB Apéndice S5 Anopheles baimaii preparación del mapa de vinculación

Tenga en cuenta: El editor no es responsable del contenido o la funcionalidad de la información de apoyo proporcionada por los autores. Cualquier consulta (que no sea el contenido faltante) debe dirigirse al autor correspondiente del artículo.


Ver el vídeo: How to compute linkage disequilibrium LD by hand. Genomics (Julio 2022).


Comentarios:

  1. Voodoom

    Lo siento, eso ha interferido ... pero este tema está muy cerca de mí. Está listo para ayudar.

  2. Taktilar

    Considero que no estás bien. Estoy seguro. Vamos a discutir. Escríbeme en PM.

  3. Bam

    Soy definitivo, lo siento, pero no se acerca absolutamente a mí.

  4. Magrel

    los felicito, magnifica idea y es debidamente

  5. Kilmaran

    ¿Qué estás tratando de decir?



Escribe un mensaje